#################### DSSP8 dataset Description ################################################# # DSSP8 is a secondary structure datasets with Eight states (H,B,E,G,I,T,S,C). There # are 5877 Non-Redundant chains (25%). This dataset was created by DSSP & PDB_select. # There are three line in each PDB, First line is PDB ID with chain, # Second is amino acid sequence in single letter code and # third line is assignment of Eight states (H,B,E,G,I,T,S,C) secondary # structure at each amino acid residue corresponding to amino acid of respective PDB # sequence, where, H=alpha helix, B=a beta bridge, E=Extended beta sheet, G=3/10 helix, # I=pi helix, T=hydrogen bonded turn, S=bend, C=coil. #################### Dataset Description end ################################################ >1a0gA GYTLWNDQIVKDEEVKIDKEDRGYQFGDGVYEVVKVYNGEMFTVNEHIDRLYASAEKIRITIPYTKDKFHQLLHELVEKNELNTGHIYFQVTRGTSPRAHQFPENTVKPVIIGYTKENPRPLENLEKGVKATFVEDIRWLRCDIKSLNLLGAVLAKQEAHEKGCYEAILHRNNTVTEGSSSNVFGIKDGILYTHPANNMIAKGITRDVVIACANEINMPVKEIPFTTHEALKMDELFVTSTTSEITPVIEIDGKLIRDGKVGEWTRKLQKQFETKIPKPL CEEEETTEEEEGGGCCBCTTBHHHHHCCEEEEEEEEETTEETTHHHHHHHHHHHHHHTTCCCSSCHHHHHHHHHHHHHHHTCSSEEEEEEEECCBCSSCSSCCCTTSCCEEEEEEEECCCCHHHHHHCEEEEEEECCCCSCTTSCBSCCHHHHHHHHHHHHTTCSEEEEEETTEEEEESSSEEEEEETTEEECCCSSTTSCCCHHHHHHHHHHHHTTCCEECCCCBHHHHTTCSEEEEEETTTEEEEEEEETTEESTTSSCCHHHHHHHHHHHTTSCCCC >1a27A ARTVVLITGCSSGIGLHLAVRLASDPSQSFKVYATLRDLKTQGRLWEAARALACPPGSLETLQLDVRDSKSVAAARERVTEGRVDVLVCNAGLGLLGPLEALGEDAVASVLDVNVVGTVRMLQAFLPDMKRRGSGRVLVTGSVGGLMGLPFNDVYCASKFALEGLCESLAVLLLPFGVHLSLIECGPVHTAFMEKVLGSPEEVLDRTDIHTFHRFYQYLAHSKQVFREAAQNPEEVAEVFLTALRAPKPTLRYFTTERFLPLLRMRLDDPSGSNYVTAMHREVFG CCEEEEESCCSSHHHHHHHHHHHTCTTCCEEEEEEESSGGGTHHHHHHHHHTTCCTTSEEEEECCTTCHHHHHHHHHTCTTSCCSEEEECCCCCCCSCGGGCCHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHTCEEEEEEEEGGGTSCCTTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGTEEEEEEEECCBSSSTTTTSCCCHHHHHHHSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCBCHHHHHHHHHHHHHCSSCCSEEESCSTTHHHHHTTTSSTTSHHHHHHHHHHHHC >1a34A TGDNSNVVTMIRAGSYPKVNPTPTWVRAIPFEVSVQSGIAFKVPVGSLFSANFRTDSFTSVTVMSVRAWTQLTPPVNEYSFVRLKPLFKTGDSTEEFEGRASNINTRASVGYRIPTNLRQNTVAADNVCEVRSNCRQVALVISCCFN CCCSCCSCCCCCCCSCCCCCSSCCEEEEEEEEEECCTTCCEEEEGGGGCCGGGTCTTCSCEEEEEEEEEECSCCSTTCCCEEEEEECCTTCCCCCCEEEECSSTTSCCEEEEECCGGGCCCBCTTSEEEEEEESSSEEEEEEEEEEC >1a3aA LFKLGAENIFLGRKAATKEEAIRFAGEQLVKGGYVEPEYVQAMLDREKLTPTYLGESIAVPHGTVEAKDRVLKTGVVFCQYPEGVRFGEEEDDIARLVIGIAARNNEHIQVITSLTNALDDESVIERLAHTTSVDEVLELLAGRK CCCCCGGGEECSCCCSSHHHHHHHHHHHHHHTTSBCTHHHHHHHHHHHHSCCEEETTEECCBCCGGGGGGBSSCEEEEEEEEEEEECSSSTTCEEEEEEEEECSTTTHHHHHHHHHHHTCSHHHHHHHHHCCCHHHHHHHTTTCC >1a3cA QKAVILDEQAIRRALTRIAHEMIERNKCILVGIKTRGIYLAKRLAERIEQIEGNPVTVGEIDITLYRNDEPLVKGADIPVDITDQKVILVDDVLYTGRTVRAGMDALVDVGRPSSIQLAVLVDRGHRELPIRADYIGKNIPTSKSEKVMVQLDEVDQNDLVAIYEN CEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEESHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEECSSCCTTSEEEEEEEEESSSHHHHHHHHHHHHHCCCSEEEEEEEEECCCCSSSCCCSEEEEECCCCSSCEEEEECHHHHSSCEEEEECC >1a3zA TWKEATLPQVKAMLEKDDGKVSGDTVTYSGKTVHVVAAAVLPGFPFPSFEVHDKKNPTLEIPAGATVDVTFINTNKGFGHSFDITKKGPPYAVMPVIDPIVAGTGFSPVPKDGKFGYTDFTWHPTAGTYYYVCQIPGHAATGMFGKIVVK CCEEECHHHHHHHHTTCCCEEETTEEECCSSEEEEEEEESCTTSCSSCEEETTEESCEEEECTTCEEEEEEEECCTTCCCCCEEESCCSCCCSSCCCCSCSEECCCCCCCBTTBEEEEEEEECCCSEEEEEECCSTTTGGGTCEEEEEEC >1a40A EASLTGAGATFPAPVYAKWADTYQKETGNKVNYQGIGSSGGVKQIIANTVDFGASDAPLSDEKLAQEGLFQFPTVIGGVVLAVNIPGLKSGELVLDGKTLGDIYLGKIKKWDDEAIAKLNPGLKLPSQNIAVVRRADGSGTSFVFTSYLAKVNEEWKNNVGTGSTVKWPIGLGGKGNDGIAAFVQRLPGAIGYVEYWYAKQNNLAYTKLISADGKPVSPTEENFANAAKGADWSKTFAQDLTNQKGEDAWPITSTTFILIHKDQKKPEQGTEVLKFFDWAYKTGAKQANDLDYASLPDSVVEQVRAAWKTNIKDSSGKPLY CCEEEEEECSTTHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHHHHHTTSSSEEEESSCCCHHHHHHHTEEEEEEEEEEEEEEECCTTCCTTTCEECHHHHHHHHHTCCCBTTCHHHHHHSTTCCCCCCBCEEEEESSCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHTCCSSSCCCSSCEEESHHHHHHHHHHHSTTEEEEEEHHHHHTTTCEECEEECTTSCEECCCHHHHHHHTTTCCTTTCSCCCCBSCCSTTCCSBEEEEEEEEESEESSHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHTTCEECCHHHHHHHHHHHHHHCEETTSCBCC >1a48A SITKTELDGILPLVARGKVRDIYEVDAGTLLFVATDRISAYDVIMENSIPEKGILLTKLSEFWFKFLSNDVRNHLVDIAPGKTIFDYLPAKLSEPKYKTQLEDRSLLVHKHKLIPLEVIVRGYITGSAWKEYVKTGTVHGLKQPQGLKESQEFPEPIFTPSTDENISPAQAAELVGEDLSRRVAELAVKLYSKCKDYAKEKGIIIADTKFEFGIDEKTNEIILVDEVLTPDSSRFWNGASYKVGESQDSYDKQFLRDWLTANKLNGVNGVKMPQDIVDRTRAKYIEAYETLTGSKWSH CCSSCCCTTSSCEEEECSSEEEEEEETTEEEEEECSCCEETTEECSSCCTTHHHHHHHHHHHHHHHTTTTCEECBCCCCTTCCGGGGSCGGGGSHHHHHHHTTSEEEEECCEECCSBEEEEEECCHHHHHHHHHHSEETTEECCSCCCTTCEEEEEEECCBCCCBCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTEEEEEEEECEEEETTTTEEEECSCCSCTTTEEEEESTTCCTTSCCCCTTTHHHHHHHHHTTCTTCSSCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC >1a62A XNLTELKNTPVSELITLGENXGLENLARXRKQDIIFAILKQHAKSGEDIFGDGVLEILQDGFGFLRSADSSYLAGPDDIYVSPSQIRRFNLRTGDTISGKIRPPKEGERYFALLKVNEVNFDKPE CBHHHHHTSCHHHHHHHHHTTTCCCCTTSCHHHHHHHHHHHHHHTTCCEEEEEEEEECTTSCEEEECGGGTTCCCTTCEEECHHHHHHTTCCTTCEEEEEEECCCTTCCSEEEEEEEEETTBCCC >1a73A 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CEEEEEEESSTTSSHHHHHHHHHHHHHHTTCCEEEECCEEESCEEETTEEECHHHHHHHHTSSSCCCHHHHCSEEESSCSCHHHHHHHHTCCCCHHHHHHHHHHHTTTCSEEEEECSSSTTCBSSSSCBHHHHHHHHTCCEEEEEECSTTHHHHHHHHHHHHHHTTCCEEEEEEECCSSCCTTHHHHHHHHHHHSSSCEEEEECCCCSCGGGSCCGGGCCGGGC >1a95A EKYIVTWDMLQIHARKLASRLMPSEQWKGIIAVSRGGLVPGALLARELGIRHVDTVCISSYNQRELKVLKRAEGDGEGFIVIDDLVDTGGTAVAIREMYPKAHFVTIFAKPAGRPLVDDYVVDIPQDTWIEQPWDMGVVFVPPIS CEEECCHHHHHHHHHHHHHHTCCGGGCCEEEEEETTTHHHHHHHHHHHTCCCEEEEEEEECCCCCEEEEECCSSCCTTEEEEEEEESSCHHHHHHHHHCTTSEEEEEEECTTTGGGCSBCSEECCTTCEEECGGGEEEEECCCCC >1a9xA 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CCCCEEEEEEEECHHHHHHTSHHHHHHHHHHCTEEEEEEEECCHHHHHHHHHTTCCSEEEESSCCCTTSCEEEEEEEEECEEEEECTTSTTTTTSCCCHHHHHTSEEEEECTTSTTHHHHHHHHHHHTCCCEEEEEESSHHHHHHHHHHTSCEEEEEGGGCCTTTCTTSEEEECBTTBCCEEEEEEEETTCCCCHHHHHHHHHHCTTCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHSCCCBC >1al6A STNLKDVLASLIPKEQARIKTFRQQHGNTAVGQITVDMSYGGMRGMKGLIYETSVLDPDEGIRFRGFSIPECQKLLPKAGGGEEPLPEGLFWLLVTGQIPTPEQVSWVSKEWAKRAALPSHVVTMLDNFPTNLHPMSQLSAAITALNSESNFARAYAEGINRTKYWEFVYEDAMDLIAKLPCVAAKIYRNLYRAGSSIGAIDSKLDWSHNFTNMLGYTDPQFTELMRLYLTIHSDHEGGNVSAHTSHLVGSALSDPYLSFAAAMNGLAGPLHGLANQEVLLWLSQLQKDLGADASDEKLRDYIWNTLNSGRVVPGYGHAVLRKTDPRYTCQREFALKHLPSDPMFKLVAQLYKIVPNVLLEQGKAKNPWPNVDAHSGVLLQYYGMTEMNYYTVLFGVSRALGVLAQLIWSRALGFPLERPKSMSTAGLEKLSAGG 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