Start: Start of ORF
End: End of ORF
Strand: Forward or Reverse Strand
Power: Spectral Power of FTG or GeneScan or Lengthen-Shuffle Algorithms
Codon: Start Codon of the ORF
Detected: Whether ORF is considered detected depending on thresholds for different FFT based algorithms; FTG: 30; GeneScan: 4; Lengthen-Shuffle: 10 (Issac et al., 2002)
GENESCAN
START END STRAND POWER CODON DETECTED
190 273 + 28.5379 ATG yes
10742 11362 + 21.1649 CTG yes
15419 15628 - 12.2751 ATG yes
88229 88315 - 2.3924 ATG no
92465 92551 + 3.1718 ATG no
243533 244012 - 9.8165 ATG yes
300937 301182 - 0.7785 GTG no
303072 303365 + 7.4815 ATG yes
336261 336590 - 6.6154 ATG yes
520492 520842 + 3.9059 ATG no
546155 546373 - 3.6137 ATG no
655789 656304 + 11.4680 ATG yes
776870 777007 + 1.2940 GTG no
777004 777123 + 1.5094 GTG no
807159 807248 - 7.1773 GTG yes
892240 892458 - 0.9824 ATG no
896054 896236 + 5.1734 ATG yes
896233 896403 + 8.6890 GTG yes
901806 902021 + 6.7413 ATG yes
902735 902941 + 9.8425 ATG yes
1145186 1145353 + 1.9315 ATG no
1167961 1168338 - 5.3327 ATG yes
1174631 1174843 + 13.2484 ATG yes
1184206 1184391 - 8.3228 ATG yes
1230201 1230431 + 1.6736 ATG no
1250884 1251105 - 2.3637 ATG no
1253790 1253954 - 3.6305 ATG no
1254888 1255160 - 6.3102 ATG yes
1257683 1257898 + 3.7254 ATG no
1258040 1258336 + 3.1897 ATG no
1262970 1263152 + 5.0703 ATG yes
1274614 1274799 + 8.5327 ATG yes
1287205 1287447 - 2.1628 TTG no
1290518 1290796 + 6.4465 TTG yes
1305277 1305489 - 13.3283 ATG yes
1307284 1307505 - 5.9509 ATG yes
1374948 1375244 + 2.5979 ATG no
1397784 1398125 - 3.7642 ATG no
1427424 1427699 - 7.2048 TTG yes
1428123 1428398 - 6.3634 GTG yes
1428636 1429094 - 3.8039 ATG no
1440986 1441486 + 2.5940 ATG no
1464103 1464435 + 5.9640 ATG yes
1506462 1506635 + 4.9094 ATG yes
1544664 1545140 - 11.4523 ATG yes
1551114 1551326 + 12.1835 ATG yes
1560119 1560325 + 16.3783 ATG yes
1561468 1561833 + 8.0210 ATG yes
1576413 1576667 - 4.1002 ATG yes
1587113 1587274 - 1.8709 ATG no
1596345 1596533 + 2.9281 GTG no
1597360 1597557 + 4.2156 ATG yes
1601634 1601906 + 7.7938 ATG yes
1619344 1619580 - 2.9479 ATG no
1621203 1621505 + 5.2916 ATG yes
1624633 1624803 + 1.4320 ATG no
1627575 1627757 + 8.9515 ATG yes
1659110 1659274 - 7.4172 ATG yes
1758657 1758905 - 4.6869 ATG yes
1763879 1764286 - 10.9345 ATG yes
1767806 1767967 + 2.9561 GTG no
1769256 1769468 + 12.0704 ATG yes
1779063 1779248 + 8.2675 ATG yes
1779942 1780307 + 8.0210 ATG yes
1824058 1824102 - 1.6590 ATG no
1923250 1923399 - 6.5500 ATG yes
1947240 1947605 + 8.0210 ATG yes
2183604 2183789 - 6.4728 ATG yes
2193911 2194123 - 13.3283 ATG yes
2198829 2199071 - 9.2765 ATG yes
2233503 2233868 - 8.0210 ATG yes
2234562 2234747 - 8.2675 ATG yes
2304182 2304307 + 4.0493 ATG yes
2398939 2398983 - 3.2145 ATG no
2399515 2399712 - 2.5653 ATG no
2603265 2603579 + 3.9516 ATG no
2609265 2609501 - 4.0738 ATG yes
2691177 2691362 - 6.4728 ATG yes
2700771 2700983 - 10.5625 ATG yes
2705881 2706108 - 8.6751 ATG yes
2762061 2762111 + 10.5798 ATG yes
2774241 2774393 - 4.3886 TTG yes
2774427 2774591 - 2.8775 ATG no
2774891 2775001 - 2.0209 GTG no
2895858 2895926 + 1.8644 ATG no
2919200 2919385 - 8.2675 ATG yes
2932012 2932308 - 3.2573 ATG no
2932423 2932641 - 2.2365 ATG no
2936444 2936608 + 3.0510 ATG no
3457718 3457765 + 3.4887 ATG no
3498740 3498946 - 4.5507 ATG yes
3724280 3724747 - 8.5278 TTG yes
4032881 4033234 + 9.5286 ATG yes
4075492 4075803 - 18.3099 ATG yes
4177630 4177746 - 3.7049 ATG no
4185260 4185538 - 6.7213 ATG yes
4359808 4360083 - 2.8770 ATG no
4609580 4609879 + 24.8166 ATG yes
4643365 4643463 - 13.3149 ATG yes
4677144 4677218 + 2.5250 ATG no
4743766 4743864 + 3.6012 ATG no
4759637 4759738 + 3.4303 ATG no
4928505 4928717 + 12.8187 ATG yes
4998682 4999125 + 17.9201 ATG yes
5041814 5042062 + 0.5796 ATG no
5074226 5074429 - 9.7359 GTG yes
5078578 5078778 + 2.8549 ATG no
5279246 5279560 + 3.8635 ATG no
5327937 5328071 - 0.9113 ATG no
FTG
START END STRAND POWER CODON DETECTED
190 273 + 5891.2959 ATG yes
10742 11362 + 4183.6200 CTG yes
15419 15628 - 400.9598 ATG yes
88229 88315 - 460.2460 ATG yes
92465 92551 + 563.5374 ATG yes
243533 244012 - 62.3474 ATG yes
300937 301182 - 19.3555 GTG no
303072 303365 + 120.9565 ATG yes
336261 336590 - 93.5462 ATG yes
520492 520842 + 38.9426 ATG yes
546155 546373 - 98.4501 ATG yes
655789 656304 + 55.2301 ATG yes
776870 777007 + 107.3841 GTG yes
777004 777123 + 152.4641 GTG yes
807159 807248 - 1311.7751 GTG yes
892240 892458 - 36.8282 ATG yes
896054 896236 + 236.0085 ATG yes
896233 896403 + 432.7668 GTG yes
901806 902021 + 225.0373 ATG yes
902735 902941 + 332.7403 ATG yes
1145186 1145353 + 101.0441 ATG yes
1167961 1168338 - 48.6719 ATG yes
1174631 1174843 + 425.5367 ATG yes
1184206 1184391 - 352.1584 ATG yes
1230201 1230431 + 42.4611 ATG yes
1250884 1251105 - 63.0677 ATG yes
1253790 1253954 - 191.7932 ATG yes
1254888 1255160 - 108.9698 ATG yes
1257683 1257898 + 110.1995 ATG yes
1258040 1258336 + 51.4999 ATG yes
1262970 1263152 + 232.5571 ATG yes
1274614 1274799 + 360.4374 ATG yes
1287205 1287447 - 51.1035 TTG yes
1290518 1290796 + 118.4889 TTG yes
1305277 1305489 - 429.7182 ATG yes
1307284 1307505 - 181.8812 ATG yes
1374948 1375244 + 42.4043 ATG yes
1397784 1398125 - 53.1216 ATG yes
1427424 1427699 - 136.1598 TTG yes
1428123 1428398 - 126.4111 GTG yes
1428636 1429094 - 27.8625 ATG no
1440986 1441486 + 13.6647 ATG no
1464103 1464435 + 72.0922 ATG yes
1506462 1506635 + 232.4803 ATG yes
1544664 1545140 - 65.5044 ATG yes
1551114 1551326 + 395.6672 ATG yes
1560119 1560325 + 552.4089 ATG yes
1561468 1561833 + 87.2348 ATG yes
1576413 1576667 - 97.1461 ATG yes
1587113 1587274 - 99.2103 ATG yes
1596345 1596533 + 117.8301 GTG yes
1597360 1597557 + 163.3419 ATG yes
1601634 1601906 + 162.9699 ATG yes
1619344 1619580 - 73.5711 ATG yes
1621203 1621505 + 88.2195 ATG yes
1624633 1624803 + 71.4056 ATG yes
1627575 1627757 + 403.1552 ATG yes
1659110 1659274 - 400.9038 ATG yes
1758657 1758905 - 104.5286 ATG yes
1763879 1764286 - 103.9160 ATG yes
1767806 1767967 + 178.4006 GTG yes
1769256 1769468 + 393.1994 ATG yes
1779063 1779248 + 349.2518 ATG yes
1779942 1780307 + 87.2347 ATG yes
1824058 1824102 - 1181.6388 ATG yes
1923250 1923399 - 422.4863 ATG yes
1947240 1947605 + 87.2346 ATG yes
2183604 2183789 - 280.8891 ATG yes
2193911 2194123 - 429.7060 ATG yes
2198829 2199071 - 225.8019 ATG yes
2233503 2233868 - 87.2359 ATG yes
2234562 2234747 - 349.2562 ATG yes
2304182 2304307 + 369.2680 ATG yes
2398939 2398983 - 2323.6276 ATG yes
2399515 2399712 - 93.4668 ATG yes
2603265 2603579 + 59.6797 ATG yes
2609265 2609501 - 99.3036 ATG yes
2691177 2691362 - 280.8865 ATG yes
2700771 2700983 - 340.0970 ATG yes
2705881 2706108 - 255.6474 ATG yes
2762061 2762111 + 5843.1385 ATG yes
2774241 2774393 - 269.2060 TTG yes
2774427 2774591 - 158.2503 ATG yes
2774891 2775001 - 230.3336 GTG yes
2895858 2895926 + 593.2831 ATG yes
2919200 2919385 - 349.2534 ATG yes
2932012 2932308 - 54.0960 ATG yes
2932423 2932641 - 65.9846 ATG yes
2936444 2936608 + 162.5946 ATG yes
3457718 3457765 + 2243.1172 ATG yes
3498740 3498946 - 159.2205 ATG yes
3724280 3724747 - 55.9647 TTG yes
4032881 4033234 + 117.5360 ATG yes
4075492 4075803 - 283.8898 ATG yes
4177630 4177746 - 373.9867 ATG yes
4185260 4185538 - 127.1382 ATG yes
4359808 4360083 - 54.4972 ATG yes
4609580 4609879 + 398.3890 ATG yes
4643365 4643463 - 1974.2199 ATG yes
4677144 4677218 + 657.4726 ATG yes
4743766 4743864 + 543.4274 ATG yes
4759637 4759738 + 478.8738 ATG yes
4928505 4928717 + 400.4712 ATG yes
4998682 4999125 + 130.9986 ATG yes
5041814 5042062 + 14.5278 ATG no
5074226 5074429 - 346.3942 GTG yes
5078578 5078778 + 105.6288 ATG yes
5279246 5279560 + 54.6665 ATG yes
5327937 5328071 - 74.3021 ATG yes
LENGTHEN-SHUFFLE
START END STRAND POWER CODON DETECTED
190 273 + 142.9366 ATG yes
10742 11362 + 87.1118 CTG yes
15419 15628 - 26.5158 ATG yes
88229 88315 - 19.0366 ATG yes
92465 92551 + 10.3891 ATG yes
243533 244012 - 7.2001 ATG no
300937 301182 - 1.3633 GTG no
303072 303365 + 10.5542 ATG yes
336261 336590 - 9.1946 ATG no
520492 520842 + 4.3065 ATG no
546155 546373 - 4.0659 ATG no
655789 656304 + 7.1685 ATG no
776870 777007 + 4.8844 GTG no
777004 777123 + 5.3333 GTG no
807159 807248 - 28.1536 GTG yes
892240 892458 - 2.8012 ATG no
896054 896236 + 8.5035 ATG no
896233 896403 + 18.0854 GTG yes
901806 902021 + 12.0722 ATG yes
902735 902941 + 19.3325 ATG yes
1145186 1145353 + 5.0287 ATG no
1167961 1168338 - 5.9122 ATG no
1174631 1174843 + 23.1422 ATG yes
1184206 1184391 - 20.0657 ATG yes
1230201 1230431 + 3.3489 ATG no
1250884 1251105 - 4.0688 ATG no
1253790 1253954 - 8.7657 ATG no
1254888 1255160 - 8.5176 ATG no
1257683 1257898 + 6.4736 ATG no
1258040 1258336 + 4.4313 ATG no
1262970 1263152 + 8.3489 ATG no
1274614 1274799 + 20.8122 ATG yes
1287205 1287447 - 2.8899 TTG no
1290518 1290796 + 7.5332 TTG no
1305277 1305489 - 25.7626 ATG yes
1307284 1307505 - 10.6922 ATG yes
1374948 1375244 + 3.5489 ATG no
1397784 1398125 - 7.1832 ATG no
1427424 1427699 - 8.1724 TTG no
1428123 1428398 - 10.0397 GTG yes
1428636 1429094 - 3.9033 ATG no
1440986 1441486 + 1.9466 ATG no
1464103 1464435 + 6.7333 ATG no
1506462 1506635 + 11.3374 ATG yes
1544664 1545140 - 6.4824 ATG no
1551114 1551326 + 22.7835 ATG yes
1560119 1560325 + 32.1404 ATG yes
1561468 1561833 + 11.5310 ATG yes
1576413 1576667 - 6.7222 ATG no
1587113 1587274 - 7.1321 ATG no
1596345 1596533 + 6.3666 GTG no
1597360 1597557 + 9.4179 ATG no
1601634 1601906 + 9.9623 ATG no
1619344 1619580 - 6.0390 ATG no
1621203 1621505 + 7.6810 ATG no
1624633 1624803 + 6.9489 ATG no
1627575 1627757 + 24.7253 ATG yes
1659110 1659274 - 15.8808 ATG yes
1758657 1758905 - 8.8931 ATG no
1763879 1764286 - 9.9378 ATG no
1767806 1767967 + 10.7754 GTG yes
1769256 1769468 + 27.2568 ATG yes
1779063 1779248 + 19.9393 ATG yes
1779942 1780307 + 11.5311 ATG yes
1824058 1824102 - 13.2179 ATG yes
1923250 1923399 - 20.8351 ATG yes
1947240 1947605 + 11.5310 ATG yes
2183604 2183789 - 16.2685 ATG yes
2193911 2194123 - 25.7623 ATG yes
2198829 2199071 - 10.4354 ATG yes
2233503 2233868 - 11.5313 ATG yes
2234562 2234747 - 19.9394 ATG yes
2304182 2304307 + 20.7420 ATG yes
2398939 2398983 - 27.2871 ATG yes
2399515 2399712 - 8.0754 ATG no
2603265 2603579 + 4.7112 ATG no
2609265 2609501 - 6.6211 ATG no
2691177 2691362 - 16.2692 ATG yes
2700771 2700983 - 21.0300 ATG yes
2705881 2706108 - 12.1922 ATG yes
2762061 2762111 + 83.8360 ATG yes
2774241 2774393 - 9.3624 TTG no
2774427 2774591 - 6.4690 ATG no
2774891 2775001 - 7.3956 GTG no
2895858 2895926 + 11.8046 ATG yes
2919200 2919385 - 19.9393 ATG yes
2932012 2932308 - 4.4123 ATG no
2932423 2932641 - 3.8946 ATG no
2936444 2936608 + 7.3735 ATG no
3457718 3457765 + 29.1664 ATG yes
3498740 3498946 - 10.6885 ATG yes
3724280 3724747 - 7.2693 TTG no
4032881 4033234 + 10.9455 ATG yes
4075492 4075803 - 26.1746 ATG yes
4177630 4177746 - 14.1537 ATG yes
4185260 4185538 - 10.8092 ATG yes
4359808 4360083 - 5.2912 ATG no
4609580 4609879 + 29.9911 ATG yes
4643365 4643463 - 47.0682 ATG yes
4677144 4677218 + 15.9292 ATG yes
4743766 4743864 + 36.5155 ATG yes
4759637 4759738 + 12.2031 ATG yes
4928505 4928717 + 25.3659 ATG yes
4998682 4999125 + 13.7645 ATG yes
5041814 5042062 + 1.0500 ATG no
5074226 5074429 - 17.8121 GTG yes
5078578 5078778 + 4.2712 ATG no
5279246 5279560 + 6.9264 ATG no
5327937 5328071 - 4.5798 ATG no