Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR251098224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]971VVLFPGTGF DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 17 0.25
VIR251101224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]974FPGTGFVEL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.27
VIR251106224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]979FVELALRAG DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1323 7 0.28
VIR251107224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]980VELALRAGD DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1304 3 0.26
VIR251117224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]990VGCSVLQEL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.26
VIR251132224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1005VLPADGVRV DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.46
VIR251133224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1006LPADGVRVQ DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5 0.49
VIR251138224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1011VRVQVVVGG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 33 0.33
VIR251155224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1028VWVYSAAGQ DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817 6 0.26
VIR251156224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1029WVYSAAGQA DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB5_0101, DRB5_0105 14 0.25
VIR251189224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1062LSVWPPVGA DRB1_0402 1 0.26
VIR251192224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1065WPPVGARAM DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.27
VIR251206224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1079YQVLAARGY DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0801, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 17 0.30
VIR251214224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1087YGYGPAFRG DRB1_0309 1 0.50
VIR251216224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1089YGPAFRGLQ DRB1_0305, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1307, DRB1_1321 6 0.65
VIR251233224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1106VFADVTLPE DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 12 0.74
VIR251243224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1116VPIRGFGIH DRB1_0806 1 0.31
VIR251245224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1118IRGFGIHPA DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 35 0.34
VIR251248224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1121FGIHPAVLD DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1323 7 0.32
VIR251262224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1135WGIVEGEQQ DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.29
VIR251272224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1145MLPFSWQGV DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.28
VIR251275224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1148FSWQGVCLH DRB1_0401, DRB1_1114, DRB1_1323 3 0.28
VIR251277224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1150WQGVCLHAS DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 13 0.28
VIR251290224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1163VRVRLAPVG DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328 10 0.38
VIR251297224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1170VGRGAVPVE DRB1_0301 1 0.32
VIR251314224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1187VLSVRQLMV DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311 6 0.26
VIR251341224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1214LEMIWTPVP DRB1_0301, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1107 6 0.28
VIR251360224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1233VVWELPPHA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_1107 5 0.28
VIR251388224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1261LEVLQSWLA DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0423 4 0.23
VIR251405224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1278VVTRGAVGP DRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813 5 0.55
VIR251421224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1294LAGAAVWGL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.29
VIR251427224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1300WGLVRSAQA DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1307 10 0.28
VIR251441224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1314VVLVDTDGS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 32 0.25
VIR251458224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1331FGARSGEPQ DRB1_0813 1 0.40
VIR251467224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1340LVVRRGRVY DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 17 0.25
VIR251468224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1341VVRRGRVYA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 32 0.44
VIR251469224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1342VRRGRVYAA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1506 24 0.44
VIR251496224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1369WRLVAGGGG DRB1_0101, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 11 0.28
VIR251498224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1371LVAGGGGTL DRB1_1506 1 0.28
VIR251517224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1390VELATGQVR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.32
VIR251519224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1392LATGQVRVA DRB1_0402 1 0.38
VIR251524224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1397VRVAVGAVG DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.31
VIR251528224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1401VGAVGVNFR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.49
VIR251539224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1412LVALGMYPG DRB1_0102 1 0.21
VIR251562224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1435VGPGVTGLA DRB1_1107 1 0.30
VIR251576224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1449MGLLGLVGS DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 30 0.23
VIR251578224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1451LLGLVGSEA DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.23
VIR251579224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1452LGLVGSEAV DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.21
VIR251592224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1465LVTMVPAGW DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 27 0.22
VIR251593224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1466VTMVPAGWS DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 9 0.28
VIR251600224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1473WSLVEAAAV DRB1_0101 1 0.25
VIR251613224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1486LTAFYGLSV DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 3 0.21
VIR251632224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1505LVHAGTGGV DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311 12 0.27
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VIR251655224990044 YP 002644731.1 polyketidesynthase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]1528VFVTASRAK DRB1_0402, DRB5_0101, DRB5_0105 3 0.31
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VIR258016224990356 YP 002645043.1 permease[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]456FIVVPAMAY DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 16 0.25
VIR258018224990356 YP 002645043.1 permease[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]458VVPAMAYLH DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB5_0101, DRB5_0105 20 0.20
VIR258022224990356 YP 002645043.1 permease[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]462MAYLHYYRI DRB1_0102, DRB1_1506 2 0.28
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VIR258025224990356 YP 002645043.1 permease[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]465LHYYRIIRR DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 13 0.28
VIR258027224990356 YP 002645043.1 permease[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]467YYRIIRRVG DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 18 0.32
VIR258028224990356 YP 002645043.1 permease[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]468YRIIRRVGD DRB1_0101, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0405, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502 31 0.33
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VIR260476224990512 YP 002645199.1 undecaprenylpyrophosphatephosphatase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]197VFASGLFSL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.61
VIR260503224990512 YP 002645199.1 undecaprenylpyrophosphatephosphatase[MycobacteriumbovisBCGstr.Tokyo172]224LVATLIAFV DRB1_0703 1 0.26
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