Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR093472449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]103IRDFYKVLP DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 3 0.35
VIR093476449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]107YKVLPEFGT DRB1_0101 1 0.53
VIR093488449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]119FVALVDAAH DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_1307 5 0.26
VIR093500449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]131IRIITDLVM DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 31 0.24
VIR093502449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]133IITDLVMNH DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0817, DRB1_1107, DRB1_1321 15 0.20
VIR093506449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]137LVMNHTSES DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 45 0.27
VIR093507449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]138VMNHTSESH DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322 8 0.27
VIR093547449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]178IIFVDTEES DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1311 22 0.29
VIR093550449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]181VDTEESNWS DRB1_0401 1 0.24
VIR093557449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]188WSFDPVRRQ DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1323 11 0.22
VIR093566449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]197FYWHRFFSH DRB1_1114, DRB1_1323 2 0.34
VIR093567449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]198YWHRFFSHQ DRB1_0813 1 0.29
VIR093568449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]199WHRFFSHQP DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1502 5 0.26
VIR093578449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]209LNYDNPAVQ DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1107 12 0.24
VIR093589449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]220MIDVIRFWL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.28
VIR093592449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]223VIRFWLGLG DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.27
VIR093593449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]224IRFWLGLGI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 28 0.25
VIR093596449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]227WLGLGIDGF DRB1_0421 1 0.25
VIR093613449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]244FEREGTNCE DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426 5 0.28
VIR093629449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]260FLKRVRKVV DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 9 0.39
VIR093630449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]261LKRVRKVVD DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1321 5 0.45
VIR093641449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]272FPGRVLLAE DRB1_0801, DRB1_0817 2 0.25
VIR093646449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]277LLAEANQWP DRB1_0401, DRB1_0421 2 0.24
VIR093653449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]284WPGDVVEYF DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0421 3 0.31
VIR093660449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]291YFGDPNTGG DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 4 0.25
VIR093673449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]304MAFHFPLMP DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 6 0.30
VIR093677449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]308FPLMPRIFM DRB1_0101, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 18 0.30
VIR093679449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]310LMPRIFMAV DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.30
VIR093683449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]314IFMAVRRES DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 33 0.21
VIR093684449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]315FMAVRRESR DRB1_0309, DRB5_0101, DRB5_0105 3 0.21
VIR093687449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]318VRRESRFPI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0804, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 23 0.26
VIR093693449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]324FPISEIIAQ DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0426, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1321 9 0.34
VIR093711449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]342WGIFLRNHD DRB1_0405, DRB1_0801, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502, DRB1_1506 12 0.28
VIR093715449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]346LRNHDELTL DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 14 0.27
VIR093738449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]369YAKDPRMKA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.30
VIR093765449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]396IELFTALLL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 10 0.24
VIR093782449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]413YYGDEIGMG DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 4 0.31
VIR093787449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]418IGMGDVIWL DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1506 14 0.28
VIR093803449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]434IPMQWTPDR DRB1_0421 1 0.28
VIR093807449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]438WTPDRNAGF DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 4 0.26
VIR093832449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]463VYGYQAVNV DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1506 3 0.38
VIR093833449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]464YGYQAVNVE DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1323 12 0.36
VIR093835449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]466YQAVNVEAQ DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0426, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1307, DRB1_1321 13 0.23
VIR093897449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]528VLCVNNLSR DRB1_0404, DRB1_0423, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.22
VIR093900449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]531VNNLSRFPQ DRB1_0305, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 25 0.49
VIR093923449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]554VELTGHVEF DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.31
VIR093948449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]579FYWFQLTTH DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0813 3 0.23
VIR093949449062116 YP 007429199.1 trehalosesynthaseTRES[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]580YWFQLTTHE DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426 6 0.22
VIR094023449062145 YP 007429228.1 phosphotyrosineproteinphosphatasePTPB(protein-tyrosine-phosphatase)(PTPase)[Mycobacteri61VARRGPGRV DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 3 0.39
VIR094037449062145 YP 007429228.1 phosphotyrosineproteinphosphatasePTPB(protein-tyrosine-phosphatase)(PTPase)[Mycobacteri75VHLLPFPDL DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.26
VIR094060449062145 YP 007429228.1 phosphotyrosineproteinphosphatasePTPB(protein-tyrosine-phosphatase)(PTPase)[Mycobacteri98FKRLLTNGG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 25 0.28
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