Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR135019449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]9ITVLKLAGC DRB1_1307 1 0.26
VIR135021449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]11VLKLAGCCL DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.28
VIR135024449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]14LAGCCLLAS DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311 4 0.28
VIR135046449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]36LGLMSNRAS DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 31 0.21
VIR135065449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]55LEGQVPAVS DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 3 0.51
VIR135069449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]59VPAVSTMVD DRB1_0405, DRB1_0410 2 0.26
VIR135083449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]73IAWLYSQRR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.25
VIR135085449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]75WLYSQRRFE DRB1_0801, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1323 7 0.28
VIR135086449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]76LYSQRRFEV DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 11 0.28
VIR135103449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]93MKLAIVSIE DRB1_0301, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1304, DRB1_1321 9 0.46
VIR135105449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]95LAIVSIEDK DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4 0.30
VIR135107449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]97IVSIEDKRF DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.29
VIR135108449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]98VSIEDKRFA DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 9 0.29
VIR135123449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]113WKGTLTGLA DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1307 5 0.28
VIR135150449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]140YVKNYQLLV DRB1_0101, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502 17 0.22
VIR135151449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]141VKNYQLLVT DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 9 0.22
VIR135170449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]160VETTPARKL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.53
VIR135200449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]190YLNLVSFGN DRB1_0101, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 8 0.21
VIR135203449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]193LVSFGNNSF DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 18 0.25
VIR135223449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]213INASDLNWQ DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5 0.28
VIR135228449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]218LNWQQAALL DRB1_0101, DRB1_0102 2 0.28
VIR135236449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]226LAGMVQSTS DRB1_0423 1 0.31
VIR135256449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]246LARRNVVLD DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304 4 0.23
VIR135261449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]251VVLDTMIEN DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107, DRB1_1506 9 0.33
VIR135287449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]277VLPQPNELP DRB1_0421 1 0.33
VIR135306449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]296FFCDYVQEY DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11 0.31
VIR135310449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]300YVQEYLSRA DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3 0.32
VIR135314449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]304YLSRAGISK DRB1_0802, DRB1_0813, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.42
VIR135330449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]320YLIRTTLDP DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1502 23 0.51
VIR135356449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]346LAGISSVMS DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426 7 0.27
VIR135362449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]352VMSVIKPGK DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1311 7 0.99
VIR135375449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]365VLAMASNRK DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB5_0101, DRB5_0105 11 0.24
VIR135376449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]366LAMASNRKY DRB1_0402 1 0.27
VIR135401449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]391LVGDGAGSI DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8 0.27
VIR135409449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]399IFKIFTTAA DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426 9 0.99
VIR135410449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]400FKIFTTAAA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 41 0.99
VIR135413449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]403FTTAAALDM DRB1_0101, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1321 7 0.25
VIR135421449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]411MGMGINAQL DRB1_1506 1 0.22
VIR135453449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]443WCVVNAGNY DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.45
VIR135455449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]445VVNAGNYRG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_1506 9 0.37
VIR135461449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]451YRGSMNVTD DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426 6 0.26
VIR135479449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]469FAKLISQVG DRB1_0405 1 0.30
VIR135482449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]472LISQVGVGR DRB1_0102 1 0.35
VIR135486449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]476VGVGRAVDM DRB1_0102 1 0.31
VIR135488449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]478VGRAVDMAI DRB1_1506 1 0.32
VIR135496449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]486IKLGLRSYA DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_1506 10 0.27
VIR135500449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]490LRSYANPGT DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 5 0.30
VIR135503449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]493YANPGTARD DRB1_0405 1 0.57
VIR135512449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]502YNPDSNESL DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 4 0.34
VIR135520449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]510LADFVKRQN DRB1_1304 1 0.30
VIR135523449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]513FVKRQNLGS DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 30 0.28
VIR135529449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]519LGSFTLGPI DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.22
VIR135534449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]524LGPIELNAL DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.31
VIR135537449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]527IELNALELS DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4 0.28
VIR135597449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]587MSKDAVGSG DRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_1107 3 0.22
VIR135635449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]625FVGFTNRYA DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 26 0.25
VIR135647449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]637YIYDDSSSP DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 5 0.25
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VIR135681449065795 YP 007432878.1 penicillin-bindingprotein1[MycobacteriumbovisBCGstr.Korea1168P]671WFAAMKPIA DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_1323 6 0.29
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