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The Promiscuous MHC Class-I Binding Peptide Prediction Server
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Allele MHC-Db
Amino acid/Position
P1
P2
P3
P4
P5
P6
P7
P8
P9
A:
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
C:
2.640
0.200
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
D:
0.030
0.003
0.059
1.000
1.000
0.490
2.370
1.000
1.000
E:
0.030
0.004
0.059
1.000
1.000
0.490
2.370
1.000
0.100
F:
1.000
0.012
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.200
G:
1.000
0.360
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.100
H:
1.000
0.160
1.000
1.000
1.000
0.055
1.000
1.000
0.200
I:
0.720
0.100
3.600
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
19.600
K:
0.330
0.038
0.504
1.000
0.100
2.130
1.000
0.205
0.100
L:
0.720
0.198
3.600
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
28.000
M:
0.720
2.370
3.600
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
20.000
N:
1.000
0.110
1.000
1.000
100.000
1.000
1.000
1.000
0.200
P:
0.100
0.021
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.100
Q:
1.000
0.710
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.100
R:
1.000
0.009
0.504
1.000
0.100
2.130
1.000
0.205
0.100
S:
2.640
1.550
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
0.200
T:
2.640
0.160
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
V:
0.720
1.201
3.600
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
1.000
W:
1.000
0.012
1.000
1.000
0.200
1.000
1.000
1.000
0.200
Y:
1.000
0.012
1.000
1.000
0.200
1.000
1.000
1.000
0.200
FINAL CONSTANT0.300
THRESHOLD (%)
1%
2%
3%
4%
5%
6%
7%
8%
9%
10%
NUMERICAL VALUE
35.117712
14.33376
7.206
3.58344
1.8219168
0.89048484
0.36
0.13095579096
0.04133052
0.0001006776

The threshold is defined as the 'percentage of best scoring natural peptides'. For example, a threshold of 1% would predict peptides in any given protein sequence which belong to the 1% best scoring natural peptides. Peptides with score greater than or equal to corresponding threshold value will be predicted as binder