VIRmiRNA | Resource for experimental viral miRNA and their targets

Result for your query miRNA sequence
>kshv-miR-k12-2
acuguag

RED	=100 % Complementary sequence
.	=Identical residue
blue alphabets	=mismatch
_	=Gap

Acc number	miRNA	Start	Alignment	End	% Identity
Query		1	`actgtag`	7
MIMAT0036715	oha-miR-139-5p	8	`.......`	2	100
MIMAT0036540	tch-miR-139-5p	8	`.......`	2	100
MIMAT0032368	ssa-miR-144-3p	7	`.......`	1	100
MIMAT0032356	ssa-miR-139-5p	8	`.......`	2	100
MIMAT0030601	prd-miR-7901-3p	2	`.......`	8	100
MIMAT0029421	ipu-miR-144	7	`.......`	1	100
MIMAT0029416	ipu-miR-139	8	`.......`	2	100
MIMAT0026225	ccr-miR-144	7	`.......`	1	100
MIMAT0026219	ccr-miR-139	8	`.......`	2	100
MIMAT0024285	ggo-miR-508	1	`.......`	7	100
MIMAT0024106	ggo-miR-139	8	`.......`	2	100
MIMAT0023765	cgr-miR-139-5p	8	`.......`	2	100
MIMAT0022803	sha-miR-139	8	`.......`	2	100
MIMAT0022616	ola-miR-139	8	`.......`	2	100
MIMAT0021762	aca-miR-139-5p	8	`.......`	2	100
MIMAT0016147	ppy-miR-1183	2	`.......`	8	100
MIMAT0015761	ppy-miR-139-5p	8	`.......`	2	100
MIMAT0014500	tgu-miR-139-5p	8	`.......`	2	100
MIMAT0012983	eca-miR-139-5p	8	`.......`	2	100
MIMAT0012744	mdo-miR-139-5p	8	`.......`	2	100
MIMAT0007951	ptr-miR-1183	2	`.......`	8	100
MIMAT0006195	mml-miR-139-5p	8	`.......`	2	100
MIMAT0026799	mml-miR-20b-3p	2	`.......`	8	100
MIMAT0006904	oan-miR-139-5p	8	`.......`	2	100
MIMAT0005828	hsa-miR-1183	2	`.......`	8	100
MIMAT0003788	bta-miR-139	8	`.......`	2	100
MIMAT0003776	gga-miR-144-3p	7	`.......`	1	100
MIMAT0003600	xtr-miR-139	8	`.......`	2	100
MIMAT0003349	dre-miR-139-5p	8	`.......`	2	100
MIMAT0002473	ppa-miR-139	8	`.......`	2	100
MIMAT0002472	lla-miR-139	8	`.......`	2	100
MIMAT0002183	kshv-miR-K12-2-5p	2	`.......`	8	100
MIMAT0002159	ssc-miR-139-5p	8	`.......`	2	100
MIMAT0004752	hsa-miR-20b-3p	1	`.......`	7	100
MIMAT0000845	rno-miR-139-5p	8	`.......`	2	100
MIMAT0000656	mmu-miR-139-5p	8	`.......`	2	100
MIMAT0000250	hsa-miR-139-5p	8	`.......`	2	100
MIMAT0037052	ssc-miR-9834-5p	6	`......_`	1	85
MIMAT0036806	oha-miR-20b-3p	1	`......_`	6	85
MIMAT0036794	oha-miR-199c-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0036726	oha-miR-144-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0036696	oha-miR-1329-5p	6	`......_`	1	85
MIMAT0036653	oha-miR-101b-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0036641	oha-let-7g-3p	1	`......_`	6	85
MIMAT0036279	chi-miR-582-5p	6	`......_`	1	85
MIMAT0035966	chi-miR-144-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0035900	chi-miR-101-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0034946	efu-miR-199	6	`......_`	1	85
MIMAT0034638	eca-miR-9093	1	`_......`	6	85
MIMAT0034375	cfa-miR-8875	3	`_......`	8	85
MIMAT0032283	ssa-miR-101b-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0032281	ssa-miR-101a-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0030616	prd-miR-993-5p	3	`_......`	8	85
MIMAT0030137	bdi-miR7710-5p	8	`_......`	3	85
MIMAT0029552	ipu-miR-7556	6	`......_`	1	85
MIMAT0029387	ipu-miR-101b	6	`......_`	1	85
MIMAT0029386	ipu-miR-101a	6	`......_`	1	85
MIMAT0031137	aja-miR-144	6	`......_`	1	85
MIMAT0028765	mdo-miR-20b-3p	1	`......_`	6	85
MIMAT0028213	hsa-miR-7151-3p	6	`_......`	1	85
MIMAT0028179	dev-miR-D8-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0026196	ccr-miR-101a	6	`......_`	1	85
MIMAT0027847	mmu-miR-6972-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0025437	pol-miR-144-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0025364	ssc-miR-144	6	`......_`	1	85
MIMAT0023729	cgr-miR-101b-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0022773	sha-miR-1329	6	`......_`	1	85
MIMAT0022322	cin-miR-5599-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0022083	aca-miR-5456	2	`_......`	7	85
MIMAT0022013	aca-miR-5402-3p	3	`_......`	8	85
MIMAT0021864	aca-miR-20b-3p	1	`......_`	6	85
MIMAT0021772	aca-miR-144-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0021747	aca-miR-1329-5p	6	`......_`	1	85
MIMAT0021711	aca-miR-101-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0021395	rmi-miR-5322	3	`_......`	8	85
MIMAT0020531	ath-miR5025	1	`......_`	6	85
MIMAT0019560	pma-miR-1329	6	`......_`	1	85
MIMAT0019496	pma-miR-190b-3p	1	`......_`	6	85
MIMAT0019475	pma-miR-144-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0018175	mghv-miR-M1-14-3p	8	`_......`	3	85
MIMAT0017985	hsa-miR-3607-3p	1	`......_`	6	85
MIMAT0016718	cin-miR-4124-5p	1	`......_`	6	85
MIMAT0015605	bmo-miR-3401	8	`......_`	3	85
MIMAT0015020	hsa-miR-548v	8	`_......`	3	85
MIMAT0015005	hsa-miR-3137	2	`_......`	7	85
MIMAT0014596	tgu-miR-144-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0027017	tgu-miR-20b-3p	1	`......_`	6	85
MIMAT0014449	tgu-miR-1329-5p	6	`......_`	1	85
MIMAT0013024	eca-miR-144	6	`......_`	1	85
MIMAT0012951	eca-miR-101	6	`......_`	1	85
MIMAT0012833	rno-miR-582-5p	6	`......_`	1	85
MIMAT0012059	bta-miR-2469	3	`......_`	8	85
MIMAT0011871	bta-miR-199c	6	`......_`	1	85
MIMAT0010185	ssc-miR-101	6	`......_`	1	85
MIMAT0009916	cfa-miR-582	6	`......_`	1	85
MIMAT0009837	cfa-miR-10b	3	`_......`	8	85
MIMAT0009234	bta-miR-144	6	`......_`	1	85
MIMAT0008255	ptr-miR-582	6	`......_`	1	85
MIMAT0007893	mdv1-miR-M31	8	`_......`	3	85
MIMAT0007825	osa-miR1872	3	`......_`	8	85
MIMAT0007760	ssc-miR-199b-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0006734	cfa-miR-144	6	`......_`	1	85
MIMAT0006600	cfa-miR-101	6	`......_`	1	85
MIMAT0006471	mml-miR-625	3	`......_`	8	85
MIMAT0006202	mml-miR-144	6	`......_`	1	85
MIMAT0007686	gga-miR-1775-3p	3	`_......`	8	85
MIMAT0007420	gga-miR-1562-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0006099	cin-miR-101	6	`......_`	1	85
MIMAT0007335	gga-miR-1457	8	`_......`	3	85
MIMAT0007281	gga-miR-1329-5p	6	`......_`	1	85
MIMAT0007011	oan-miR-101	6	`......_`	1	85
MIMAT0006903	oan-miR-144-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0006854	oan-miR-20b-3p	1	`......_`	6	85
MIMAT0006798	oan-miR-1329-5p	6	`......_`	1	85
MIMAT0004114	mdo-miR-144-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0004098	mdo-miR-101-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0003687	xtr-miR-144	6	`......_`	1	85
MIMAT0003662	xtr-miR-101a	6	`......_`	1	85
MIMAT0003619	xtr-miR-199a-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0003520	bta-miR-101	6	`......_`	1	85
MIMAT0003446	rlcv-miR-rL1-15-3p	3	`_......`	8	85
MIMAT0003040	tni-miR-101b	6	`......_`	1	85
MIMAT0003039	fru-miR-101b	6	`......_`	1	85
MIMAT0003021	tni-miR-144	6	`......_`	1	85
MIMAT0003020	fru-miR-144	6	`......_`	1	85
MIMAT0002903	tni-miR-101a	6	`......_`	1	85
MIMAT0002902	fru-miR-101a	6	`......_`	1	85
MIMAT0002433	mne-miR-101	6	`......_`	1	85
MIMAT0002432	lla-miR-101	6	`......_`	1	85
MIMAT0002431	mml-miR-101-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0002430	ptr-miR-101	6	`......_`	1	85
MIMAT0002429	ppy-miR-101	6	`......_`	1	85
MIMAT0002428	ppa-miR-101	6	`......_`	1	85
MIMAT0002427	age-miR-101	6	`......_`	1	85
MIMAT0002426	sla-miR-101	6	`......_`	1	85
MIMAT0002425	ggo-miR-101	6	`......_`	1	85
MIMAT0002265	ppa-miR-144	6	`......_`	1	85
MIMAT0002264	mne-miR-144	6	`......_`	1	85
MIMAT0002263	ppy-miR-144	6	`......_`	1	85
MIMAT0002262	ptr-miR-144	6	`......_`	1	85
MIMAT0001841	dre-miR-144-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0001815	dre-miR-101b	6	`......_`	1	85
MIMAT0001814	dre-miR-101a	6	`......_`	1	85
MIMAT0026551	gga-miR-20b-3p	1	`......_`	6	85
MIMAT0003155	dre-miR-199-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0003721	gga-miR-199-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0026504	gga-miR-196-2-3p	6	`_......`	1	85
MIMAT0000850	rno-miR-144-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0000823	rno-miR-101a-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0000783	rno-miR-10b-5p	3	`_......`	8	85
MIMAT0000615	rno-miR-101b-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0000436	hsa-miR-144-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0000156	mmu-miR-144-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0000133	mmu-miR-101a-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0004519	mmu-let-7g-3p	1	`......_`	6	85
MIMAT0000099	hsa-miR-101-3p	6	`......_`	1	85