Result for your query miRNA sequence
>hsv1-miR-425
uagcaguu

RED =100 % Complementary sequence
.=Identical residue
blue alphabets=mismatch
_=Gap


Acc numbermiRNAStartAlignmentEnd% Identity
Query1tagcagtt8
MIMAT0034304cfa-miR-88142......._887
MIMAT0025154mmu-miR-64022_.......887
MIMAT0023419hco-miR-5924b7_.......187
MIMAT0023404hco-miR-5924a-3p7_.......187
MIMAT0022382mmu-miR-5626-3p2_.......887
MIMAT0007710gga-miR-17968_.......287
MIMAT0015252cin-miR-34-3p7_.......187
MIMAT0006049odi-miR-14961......._787
MIMAT0005548mcmv-miR-m59-12......._887
MIMAT0032977ppc-miR-8254-3p1.g......887
MIMAT0029642crm-miR-18241.g......887
MIMAT0025093mmu-miR-63501......g.887
MIMAT0025089mmu-miR-63461......g.887
MIMAT0022292hsa-miR-548au-3p1.g......887
MIMAT0022748xtr-miR-449c-3p8......c.187
MIMAT0018895tca-miR-3896-3p8.t......187
MIMAT0016742cin-miR-4142-5p1......c.887
MIMAT0026780gga-miR-1731-3p1.g......887
MIMAT0007542gga-miR-16611......a.887
MIMAT0036746oha-miR-16b-5p1......__675
MIMAT0036744oha-miR-16a-5p1......__675
MIMAT0036742oha-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0036740oha-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0036561tch-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0036552tch-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0036549tch-miR-195-5p1......__675
MIMAT0036306chi-miR-93-3p6_......_175
MIMAT0036030chi-miR-195-5p1......__675
MIMAT0035996chi-miR-16b-5p1......__675
MIMAT0035994chi-miR-16a-5p1......__675
MIMAT0035992chi-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0035990chi-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0035776tae-miR9665-3p3......__875
MIMAT0035728rno-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0035525bdi-miR444d2__......775
MIMAT0035524bdi-miR444c2__......775
MIMAT0035523bdi-miR444b2__......775
MIMAT0035313gsa-miR-1992-3p3_......_875
MIMAT0035188efu-miR-151......__675
MIMAT0035087efu-miR-161......__675
MIMAT0034757eca-miR-91772_......_775
MIMAT0034267gra-miR7502f3......__875
MIMAT0033247ppc-miR-8349-3p6......__175
MIMAT0033186ppc-miR-8245b-5p8_......_375
MIMAT0032785cel-miR-8186-5p6_......_175
MIMAT0032410ssa-miR-16c-5p1......__675
MIMAT0032408ssa-miR-16b-5p1......__675
MIMAT0032405ssa-miR-16a-5p1......__675
MIMAT0032401ssa-miR-15d-5p1......__675
MIMAT0032398ssa-miR-15c-5p1......__675
MIMAT0032396ssa-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0032394ssa-miR-15a-5p3......__875
MIMAT0031758bma-miR-53662......__775
MIMAT0031629bbe-miR-2066-3p6_......_175
MIMAT0030366hhi-miR-15a1......__675
MIMAT0030036oar-miR-16b1......__675
MIMAT0029875mmu-miR-7680-3p6_......_175
MIMAT0029577ipu-miR-457b1......__675
MIMAT0029432ipu-miR-16b1......__675
MIMAT0029431ipu-miR-15b1......__675
MIMAT0029430ipu-miR-15a1......__675
MIMAT0029337lja-miR75226__......175
MIMAT0028793mdo-miR-7373a-3p6_......_175
MIMAT0028581mdo-miR-449c-3p6__......175
MIMAT0028569mdo-miR-7292-3p6......__175
MIMAT0028428mmu-miR-7230-5p8_......_375
MIMAT0026235ccr-miR-16c1......__675
MIMAT0026234ccr-miR-16b1......__675
MIMAT0026233ccr-miR-16a1......__675
MIMAT0026232ccr-miR-15b1......__675
MIMAT0026228ccr-miR-15a1......__675
MIMAT0027981mmu-miR-7038-3p7_......_275
MIMAT0027953mmu-miR-7024-3p3_......_875
MIMAT0025756gga-miR-6655-5p7......__275
MIMAT0025557bta-miR-503-5p1......__675
MIMAT0025537bta-miR-65191......__675
MIMAT0025451hsa-miR-6499-3p1_......_675
MIMAT0025096mmu-miR-63531......__675
MIMAT0025076mmu-miR-195b1......__675
MIMAT0024203ggo-miR-5031......__675
MIMAT0024014cgr-miR-93-3p6_......_175
MIMAT0023829cgr-miR-1951......__675
MIMAT0023793cgr-miR-16-5p1......__675
MIMAT0023791cgr-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0023789cgr-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0023557tca-miR-6008-5p7_......_275
MIMAT0023510hhv6b-miR-Ro6-1-5p2_......_775
MIMAT0022650ola-miR-15a1......__675
MIMAT0022613ola-miR-161......__675
MIMAT0022448meu-miR-16c1......__675
MIMAT0022447meu-miR-15c1......__675
MIMAT0022345cin-miR-5609-5p1_......_675
MIMAT0022304hsa-miR-548av-3p8__......375
MIMAT0022262zma-miR444b2__......775
MIMAT0022261zma-miR444a2__......775
MIMAT0022255hsa-miR-4524b-5p2......__775
MIMAT0021801aca-miR-16b-5p1......__675
MIMAT0021799aca-miR-16a-5p1......__675
MIMAT0021792aca-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0021790aca-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0021595asu-miR-5366-3p2......__775
MIMAT0021214mtr-miR5229b2......__775
MIMAT0021213mtr-miR5229a2......__775
MIMAT0020286ssp-miR444c-3p2__......775
MIMAT0020285ssp-miR444b.22__......775
MIMAT0020283ssp-miR444a2__......775
MIMAT0020543hvu-miR444b2__......775
MIMAT0020469bfl-miR-48836_......_175
MIMAT0019659pma-miR-46256_......_175
MIMAT0019390pma-miR-18b-3p6_......_175
MIMAT0019388pma-miR-18a-3p7_......_275
MIMAT0019381pma-miR-16-5p1......__675
MIMAT0019380pma-miR-15b1......__675
MIMAT0019379pma-miR-15a1......__675
MIMAT0019062hsa-miR-4524a-5p2......__775
MIMAT0019056hsa-miR-45192_......_775
MIMAT0018558ame-miR-37806__......175
MIMAT0016908hsa-miR-42771__......675
MIMAT0016906hsa-miR-42742_......_775
MIMAT0016606cin-miR-4059-5p1......__675
MIMAT0016397cin-miR-15-5p1......__675
MIMAT0017861rno-miR-35756_......_175
MIMAT0015926ppy-miR-5031......__675
MIMAT0015790ppy-miR-1951......__675
MIMAT0017693aly-miR853-5p6......__175
MIMAT0014942mmu-miR-3105-3p6_......_175
MIMAT0014798api-miR-30551__......675
MIMAT0014619tgu-miR-15c-5p1......__675
MIMAT0014597tgu-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0014588tgu-miR-16b-5p1......__675
MIMAT0014586tgu-miR-16c1......__675
MIMAT0014583tgu-miR-16a-5p1......__675
MIMAT0014555tgu-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0015357zma-miR399h-5p3__......875
MIMAT0013928ssc-miR-1951......__675
MIMAT0013227eca-miR-5031......__675
MIMAT0013083eca-miR-15a1......__675
MIMAT0013027eca-miR-1951......__675
MIMAT0012955eca-miR-161......__675
MIMAT0012954eca-miR-15b1......__675
MIMAT0012760mdo-miR-1951......__675
MIMAT0012599bmo-miR-27233_......_875
MIMAT0011428cel-miR-2208a-3p3__......875
MIMAT0011243sme-miR-1992-3p3_......_875
MIMAT0010189ssc-miR-5031......__675
MIMAT0009722lgi-miR-19923_......_875
MIMAT0009713cla-miR-19923_......_875
MIMAT0009700cte-miR-19923_......_875
MIMAT0009242bta-miR-16a1......__675
MIMAT0008176ptr-miR-5031......__675
MIMAT0008060ptr-miR-1951......__675
MIMAT0011140xla-miR-15c1......__675
MIMAT0007766osa-miR1847.12__......775
MIMAT0007754ssc-miR-161......__675
MIMAT0007753ssc-miR-15a1......__675
MIMAT0006746cfa-miR-5031......__675
MIMAT0006692cfa-miR-1951......__675
MIMAT0006676cfa-miR-15b1......__675
MIMAT0006648cfa-miR-161......__675
MIMAT0006647cfa-miR-15a1......__675
MIMAT0006367mml-miR-503-5p1......__675
MIMAT0026860mml-miR-374b-3p2......__775
MIMAT0006228mml-miR-195-5p1......__675
MIMAT0007739gga-miR-16c-5p1......__675
MIMAT0007737gga-miR-15c-5p1......__675
MIMAT0007427gga-miR-15677_......_275
MIMAT0007405gga-miR-1551-5p2......__775
MIMAT0005976osa-miR444f2__......775
MIMAT0005975osa-miR444e2__......775
MIMAT0005973osa-miR444d.22__......775
MIMAT0005970osa-miR444c.22__......775
MIMAT0005968osa-miR444b.22__......775
MIMAT0007166oan-miR-16a-5p1......__675
MIMAT0007164oan-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0007093oan-miR-1422j-3p8__......375
MIMAT0007052oan-miR-16b-5p1......__675
MIMAT0007050oan-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0006894oan-miR-1422i-3p8__......375
MIMAT0006847oan-miR-16c-5p1......__675
MIMAT0006845oan-miR-15c-5p1......__675
MIMAT0005290rno-miR-883-3p7__......275
MIMAT0005271smo-miR11133_......_875
MIMAT0004956hsa-miR-374b-3p3......__875
MIMAT0004851mmu-miR-883b-3p7__......275
MIMAT0004849mmu-miR-883a-3p7__......275
MIMAT0004335bta-miR-1951......__675
MIMAT0004334bta-miR-15a1......__675
MIMAT0026715mdo-miR-93-3p6_......_175
MIMAT0004145mdo-miR-16-5p1......__675
MIMAT0004144mdo-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0012115sme-miR-133b-5p8......__375
MIMAT0004218ath-miR780.13......__875
MIMAT0003938ath-miR779.18......__375
MIMAT0003792bta-miR-15b1......__675
MIMAT0003719ebv-miR-BART20-5p1......__675
MIMAT0003668xtr-miR-16b1......__675
MIMAT0003651xtr-miR-15c1......__675
MIMAT0003563xtr-miR-16a1......__675
MIMAT0003562xtr-miR-16c1......__675
MIMAT0003561xtr-miR-15b1......__675
MIMAT0003560xtr-miR-15a1......__675
MIMAT0003525bta-miR-16b1......__675
MIMAT0003213rno-miR-503-5p1......__675
MIMAT0003188mmu-miR-503-5p1......__675
MIMAT0003108tni-miR-161......__675
MIMAT0003107fru-miR-161......__675
MIMAT0003106tni-miR-15a1......__675
MIMAT0003105fru-miR-15a1......__675
MIMAT0003086tni-miR-15b1......__675
MIMAT0003085fru-miR-15b1......__675
MIMAT0002874hsa-miR-503-5p1......__675
MIMAT0026602mml-miR-93-3p6_......_175
MIMAT0002657lla-miR-161......__675
MIMAT0002656lla-miR-15a1......__675
MIMAT0002655ptr-miR-161......__675
MIMAT0002654ptr-miR-15a1......__675
MIMAT0002653ppy-miR-161......__675
MIMAT0002652ppy-miR-15a1......__675
MIMAT0002651mml-miR-16-5p1......__675
MIMAT0002650mml-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0002649lca-miR-161......__675
MIMAT0002648lca-miR-15a1......__675
MIMAT0002647ppa-miR-161......__675
MIMAT0002646ppa-miR-15a1......__675
MIMAT0002645sla-miR-161......__675
MIMAT0002644sla-miR-15a1......__675
MIMAT0002643mne-miR-161......__675
MIMAT0002642mne-miR-15a1......__675
MIMAT0002641ggo-miR-161......__675
MIMAT0002640ggo-miR-15a1......__675
MIMAT0002639age-miR-161......__675
MIMAT0002638age-miR-15a1......__675
MIMAT0002317ppa-miR-1951......__675
MIMAT0002316ggo-miR-1951......__675
MIMAT0002209mne-miR-15b1......__675
MIMAT0002208lla-miR-15b1......__675
MIMAT0002207mml-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0002206ptr-miR-15b1......__675
MIMAT0002205ppy-miR-15b1......__675
MIMAT0002204ppa-miR-15b1......__675
MIMAT0002203age-miR-15b1......__675
MIMAT0002202ggo-miR-15b1......__675
MIMAT0002125ssc-miR-15b1......__675
MIMAT0001776dre-miR-16c-5p1......__675
MIMAT0001775dre-miR-16b1......__675
MIMAT0001774dre-miR-16a1......__675
MIMAT0001773dre-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0001772dre-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0005790osa-miR444a-3p.22__......775
MIMAT0001154gga-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0001117gga-miR-15a1......__675
MIMAT0001116gga-miR-16-5p1......__675
MIMAT0000870rno-miR-195-5p1......__675
MIMAT0017109rno-miR-93-3p6_......_175
MIMAT0000785rno-miR-16-5p1......__675
MIMAT0000784rno-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0004636mmu-miR-93-3p6_......_175
MIMAT0000527mmu-miR-16-5p1......__675
MIMAT0000526mmu-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0000461hsa-miR-195-5p1......__675
MIMAT0000417hsa-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0015118cel-miR-244-3p7_......_275
MIMAT0000225mmu-miR-195a-5p1......__675
MIMAT0000124mmu-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0004509hsa-miR-93-3p6_......_175
MIMAT0000069hsa-miR-16-5p1......__675
MIMAT0000068hsa-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0015106cel-miR-65-3p6......__175
MIMAT0020309cel-miR-49-5p2__......775