Result for your query miRNA sequence
>rlcv-miR-rl1-22-3p
ucaccguu

RED =100 % Complementary sequence
.=Identical residue
blue alphabets=mismatch
_=Gap


Acc numbermiRNAStartAlignmentEnd% Identity
Query1tcaccgtt8
MIMAT0033053ppc-miR-8277-5p8........1100
MIMAT0016340ahy-miR3514-3p1........8100
MIMAT0016944rlcv-miR-rL1-22-3p1........8100
MIMAT0019241oar-miR-433-5p8......._287
MIMAT0013544cte-miR-2691-5p8......._287
MIMAT0026875mml-miR-433-5p8......._287
MIMAT0003442rlcv-miR-rL1-12-3p7_.......187
MIMAT0017192rno-miR-433-5p8......._287
MIMAT0026554hsa-miR-433-5p8......._287
MIMAT0001419mmu-miR-433-5p8......._287
MIMAT0033895atr-miR86061......a.887
MIMAT0031048mdo-miR-181b-3-3p1......a.887
MIMAT0011790dme-miR-2282-3p8......a.187
MIMAT0036929oha-miR-451-??3__......875
MIMAT0036237chi-miR-451-5p3__......875
MIMAT0035795tae-miR397-5p1......__675
MIMAT0035394nve-miR-94338......__375
MIMAT0035327gsa-miR-9391-3p1__......675
MIMAT0035259gsa-miR-36-3p1......__675
MIMAT0035029efu-miR-4116_......_175
MIMAT0034747eca-miR-91698_......_375
MIMAT0034614eca-miR-90697_......_275
MIMAT0034193gra-miR7502e8__......375
MIMAT0033645sma-miR-8463-5p8......__375
MIMAT0033627sma-miR-8457-3p1......__675
MIMAT0033467str-miR-37b-3p1......__675
MIMAT0033459str-miR-8393-3p1......__675
MIMAT0033455str-miR-37a-3p1......__675
MIMAT0033453str-miR-8392-3p2......__775
MIMAT0033437str-miR-40-3p1......__675
MIMAT0033435str-miR-8387-3p1......__675
MIMAT0033433str-miR-8386-3p2......__775
MIMAT0033376str-miR-1175-5p6......__175
MIMAT0033233ppc-miR-2235a-9-3p1......__675
MIMAT0033211ppc-miR-8333-3p8__......375
MIMAT0033070ppc-miR-8283-3p1......__675
MIMAT0033034ppc-miR-2235a-11-3p1......__675
MIMAT0033005ppc-miR-2235a-10-3p1......__675
MIMAT0032983ppc-miR-8257-3p3......__875
MIMAT0032953ppc-miR-2235d-3p1......__675
MIMAT0032951ppc-miR-2235c-3p1......__675
MIMAT0032946ppc-miR-8243-5p1......__675
MIMAT0032913ppc-miR-8232-3p1......__675
MIMAT0032889ppc-miR-42c-3p1......__675
MIMAT0032883ppc-miR-36-3p1......__675
MIMAT0032851ppc-miR-2235b-3p1......__675
MIMAT0031749bma-miR-36a1......__675
MIMAT0031647bbe-miR-216-3p7_......_275
MIMAT0030813prd-miR-39-3p1......__675
MIMAT0030766prd-miR-7948d-5p6......__175
MIMAT0030715prd-miR-35a-3p1......__675
MIMAT0030681prd-miR-40-3p1......__675
MIMAT0030567prd-miR-37-3p1......__675
MIMAT0030557prd-miR-7940b-3p1......__675
MIMAT0030511prd-miR-35b-3p1......__675
MIMAT0029941cbn-miR-35n1......__675
MIMAT0029940cbn-miR-35m1......__675
MIMAT0029939cbn-miR-35l1......__675
MIMAT0029938cbn-miR-35k1......__675
MIMAT0029937cbn-miR-35j1......__675
MIMAT0029936cbn-miR-35i1......__675
MIMAT0029935cbn-miR-35h1......__675
MIMAT0029934cbn-miR-35g1......__675
MIMAT0029933cbn-miR-35f1......__675
MIMAT0029932cbn-miR-35e1......__675
MIMAT0029931cbn-miR-35d1......__675
MIMAT0029930cbn-miR-35c1......__675
MIMAT0029929cbn-miR-35b1......__675
MIMAT0029928cbn-miR-35a1......__675
MIMAT0029926cbn-miR-381......__675
MIMAT0029925cbn-miR-391......__675
MIMAT0029924crm-miR-35i1......__675
MIMAT0029921crm-miR-361......__675
MIMAT0029920crm-miR-35h1......__675
MIMAT0029919cbr-miR-35g1......__675
MIMAT0029918cbr-miR-35f1......__675
MIMAT0027848mmu-miR-6973a-5p7_......_275
MIMAT0024361ppy-miR-548e8__......375
MIMAT0024334mml-miR-12506_......_175
MIMAT0024235ggo-miR-12506_......_175
MIMAT0023444hco-miR-40a1......__675
MIMAT0023430hco-miR-40d1......__675
MIMAT0023429hco-miR-40c1......__675
MIMAT0023323hco-miR-40b1......__675
MIMAT0023050tur-miR-5730-5p1......__675
MIMAT0021960aca-miR-451-5p3__......875
MIMAT0021549asu-miR-5348-3p1......__675
MIMAT0021547asu-miR-36f-3p1......__675
MIMAT0021545asu-miR-5347-3p8_......_375
MIMAT0021448asu-miR-36e-3p1......__675
MIMAT0021446asu-miR-36d-3p1......__675
MIMAT0021444asu-miR-36c-3p1......__675
MIMAT0021442asu-miR-36b-3p1......__675
MIMAT0021440asu-miR-36a-3p1......__675
MIMAT0021388rmi-miR-5316b1......__675
MIMAT0021387rmi-miR-5316a1......__675
MIMAT0019964hsa-miR-47926......__175
MIMAT0019682osa-miR812o-3p7__......275
MIMAT0019631pma-miR-45986__......175
MIMAT0019553pma-miR-4513__......875
MIMAT0018382ssc-miR-4513__......875
MIMAT0018883tca-miR-3791-3p1......__675
MIMAT0018827tca-miR-3867-3p3_......_875
MIMAT0018570ame-miR-37911......__675
MIMAT0018538ame-miR-37208_......_375
MIMAT0016175ppy-miR-12506_......_175
MIMAT0015896ppy-miR-4513__......875
MIMAT0015489bmo-miR-33018......__375
MIMAT0014533tgu-miR-4513__......875
MIMAT0014103bma-miR-36b1......__675
MIMAT0014102bma-miR-36c1......__675
MIMAT0013041eca-miR-4513__......875
MIMAT0013646bmo-miR-2768-5p6......__175
MIMAT0013530cte-miR-361......__675
MIMAT0012442dsi-miR-968-3p1__......675
MIMAT0011720ppc-miR-2251a1......__675
MIMAT0011714ppc-miR-381......__675
MIMAT0011690ppc-miR-2240a1......__675
MIMAT0011681ppc-miR-2235a-3p1......__675
MIMAT0011654ppc-miR-42b1......__675
MIMAT0011647ppc-miR-371......__675
MIMAT0011641ppc-miR-42a1......__675
MIMAT0011605crm-miR-35g1......__675
MIMAT0011603crm-miR-381......__675
MIMAT0011532crm-miR-421......__675
MIMAT0011514crm-miR-35f1......__675
MIMAT0011513crm-miR-35e1......__675
MIMAT0011739crm-miR-35d1......__675
MIMAT0011512crm-miR-35c-3p1......__675
MIMAT0011511crm-miR-35b1......__675
MIMAT0011510crm-miR-35a1......__675
MIMAT0011506crm-miR-391......__675
MIMAT0011505crm-miR-401......__675
MIMAT0011504crm-miR-411......__675
MIMAT0011489cbr-miR-41b1......__675
MIMAT0011483cbr-miR-35b1......__675
MIMAT0011470cbr-miR-35d-3p1......__675
MIMAT0011468cbr-miR-35e1......__675
MIMAT0011467cbr-miR-35c1......__675
MIMAT0020940sbi-miR397-3p1......__675
MIMAT0011261sme-miR-36c-3p1......__675
MIMAT0011242sme-miR-36b-3p1......__675
MIMAT0009870cfa-miR-4513__......875
MIMAT0009794nve-miR-2036-5p6......__175
MIMAT0019150bfl-miR-216-3p7_......_275
MIMAT0009323bta-miR-4513__......875
MIMAT0008234ptr-miR-5538__......375
MIMAT0008153ptr-miR-4513__......875
MIMAT0007976ptr-miR-12506_......_175
MIMAT0026902mml-miR-598-5p7......__275
MIMAT0006335mml-miR-4513__......875
MIMAT0007662gga-miR-17557......__275
MIMAT0007634gga-miR-17321_......_675
MIMAT0007580gga-miR-1689-3p7......__275
MIMAT0007059oan-miR-181c-3p2......__775
MIMAT0006901oan-miR-4513__......875
MIMAT0005902hsa-miR-1250-5p6_......_175
MIMAT0005536mcmv-miR-m01-3-5p6......__175
MIMAT0005324rno-miR-598-5p7......__275
MIMAT0005508dme-miR-990-5p3......__875
MIMAT0017283mmu-miR-598-5p7......__275
MIMAT0004115mdo-miR-4513__......875
MIMAT0003982sme-miR-36a-3p1......__675
MIMAT0003775gga-miR-4513__......875
MIMAT0003705xtr-miR-4513__......875
MIMAT0026620hsa-miR-598-5p7......__275
MIMAT0003216hsa-miR-5538__......375
MIMAT0001634dre-miR-4513__......875
MIMAT0001633rno-miR-451-5p3__......875
MIMAT0001632mmu-miR-451a3__......875
MIMAT0001631hsa-miR-451a3__......875
MIMAT0001318cbr-miR-41a1......__675
MIMAT0001317cbr-miR-401......__675
MIMAT0001316cbr-miR-391......__675
MIMAT0001315cbr-miR-381......__675
MIMAT0001314cbr-miR-361......__675
MIMAT0001313cbr-miR-35a1......__675
MIMAT0000013cel-miR-42-3p1......__675
MIMAT0000012cel-miR-41-3p1......__675
MIMAT0000011cel-miR-40-3p1......__675
MIMAT0000010cel-miR-39-3p1......__675
MIMAT0000009cel-miR-38-3p1......__675
MIMAT0000008cel-miR-37-3p1......__675
MIMAT0000007cel-miR-36-3p1......__675
MIMAT0000006cel-miR-35-3p1......__675