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Ebola Virus Computational Resources (EbolaVCR) is the in silico resources developed to facilitate scientific community fighting against deadly virus EBOLA. This server enlists possible vaccine candidates, therapeutic siRNAs and other related resources.
Reference: Dhanda et. al. (2016) A web-based resource for designing therapeutics against Ebola Virus. Sci Rep. 6:24782.
AntigenVP24
StrainTai-Forest Ebola Virus (TAFV)
Number of strain5
Gene IDgi_302315376
Protein IDYP_003815430.1
Mapped EpitopeVisualize
Sequence conservationVisualize Alignment
IDstartPeptideCTLMHC I allelesMHC I allele CountHLA allelesHLA allele Count MHC II allelesMHC II allele CountB cell epitopeInterferon-gamma inducerInterleukin-4 stimulator
18283Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)97 ILAAGIQDQ NNA0NA0DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_132210N0.16
18428Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)242 ILEFNSSLA NHLA-A1, HLA-B*512NA0DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_15064N0.11
18343Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)157 ILKFINQLD NNA0NA0DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_04103N0.04
18429Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)243 LEFNSSLAI NHLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*3701, HLA-B40, HLA-B*4403, HLA-B*51, HLA-B*5201, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B60, HLA-B61, MHC-Kk12NA0DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB1_1501, DRB1_150613N0.19
18265Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)79 LFQNPNSTI NHLA-A24, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5301, HLA-Cw*0401, MHC-Kd, MHC-Kk7NA0DRB1_0401, DRB1_04212N0.02
18243Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)57 LHRLKTSDF NHLA-B*0702, HLA-B*3801, HLA-B*513NA0DRB1_0301, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_132812Y0.01
18353Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)167 LHVVNYNGL NHLA-B*3801, HLA-B*3901, HLA-B*3902, HLA-B*51, HLA-Cw*0301, MHC-Db, MHC-Db revised, MHC-Kb8NA0DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_15063N0.19
18344Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)158 LKFINQLDA NHLA-A20 Cattle, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5401, MHC-Db5NA0DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_150619N0.17
18413Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)227 LKTLAKKPA NHLA-A20 Cattle, HLA-B*0702, HLA-B*513NA0DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_132823N0.03
18242Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)56 LLHRLKTSD NNA0NA0DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_13045Y0.04
18277Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)91 LWALRVILA NHLA-B*51, HLA-B*53012NA0DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_13116N0.54
18240Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)54 MALLHRLKT NHLA-B14, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*58015NA0DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_150611Y0.11
18356Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)170 VNYNGLLSS NNA0NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_150633N0.18
18221Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)35 VQGWKVTWA NHLA-A*0201, HLA-B*2702, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B625NA0DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_132311N0.14
18339Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)153 VRSNILKFI NHLA-B14, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*3701, HLA-B*3901, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-Cw*06028NA0DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_132820N0.22
18355Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)169 VVNYNGLLS NMHC-Db revised1NA0DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_150636N0.23
18278Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)92 WALRVILAA YHLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B*5801, HLA-B618HLA-B*0702, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*0110DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_132316N0.80
18358Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)172 YNGLLSSIE NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_04214N0.02
18194Tai-Forest Ebola Virus (TAFV)8 YNLISPKKD NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_0405, DRB1_0801, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_010510N0.99