Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last five columns present the fields related to MHC class II prediction using Propred followed by prediction of interleukin-4 inducing peptides. The sixth column tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The seventh column counts the number of MHC class II alleles for that peptide. The eighth column depicts the prediction result of IL4pred server. The last column display the score of peptides from IL4pred server.


Total number of predicted 9mer peptides are 171460 (corresponding to browse type th2)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count) IL4 prediction score
VIR177355378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]63YGIQRIHPL DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 14 0.28
VIR177357378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]65IQRIHPLRN DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 24 0.28
VIR177360378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]68IHPLRNVMI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1501, DRB1_1506 12 0.28
VIR177363378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]71LRNVMILAG DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 40 0.27
VIR177366378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]74VMILAGAGV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 15 0.28
VIR177392378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]100FFADQQWSH DRB1_0305 1 0.24
VIR177404378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]112WRGELMPHY DRB1_0421 1 0.28
VIR177408378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]116LMPHYQQAQ DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323 7 0.28
VIR177441378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]149MGFGDTWVP DRB1_0402 1 0.22
VIR177447378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]155WVPTPVGVF DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 16 0.23
VIR177452378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]160VGVFFGPDG DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.22
VIR177473378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]181FGGAGPART DRB1_0101 1 0.23
VIR177502378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]210VKNYLGLAE DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1304, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 7 0.23
VIR177506378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]214LGLAESAGA DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423 6 0.29
VIR177516378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]224VIPMTTVKG DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 21 0.26
VIR177517378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]225IPMTTVKGF DRB1_0703 1 0.29
VIR177519378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]227MTTVKGFER DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.30
VIR177522378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]230VKGFERRSD DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 14 0.30
VIR177533378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]241WEVRTVRTG DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 13 0.22
VIR177543378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]251WLRRDRRTF DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 19 0.25
VIR177556378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]264LVLAAGTWG DRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_0105 4 0.28
VIR177557378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]265VLAAGTWGT DRB1_0402 1 0.28
VIR177563378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]271WGTQHLLFK DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1323 3 0.28
VIR177568378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]276LLFKMRDRG DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813 4 0.28
VIR177569378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]277LFKMRDRGR DRB5_0101, DRB5_0105 2 0.28
VIR177570378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]278FKMRDRGRL DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1502, DRB1_1506 16 0.28
VIR177572378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]280MRDRGRLPG DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1506 11 0.37
VIR177588378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]296LTRTNSESI DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.21
VIR177596378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]304IVGAATLKV DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 46 0.41
VIR177602378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]310LKVNPDLDL DRB1_1501, DRB1_1506 2 0.34
VIR177614378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]322VAITSSIHP DRB1_0701, DRB1_0703 2 0.26
VIR177658378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]366VPRWRQLLQ DRB1_0402 1 0.27
VIR177676378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]384IRMLNPRQW DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 36 0.21
VIR177684378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]392WSERTVIAL DRB1_0817 1 0.23
VIR177689378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]397VIALVMQHL DRB1_0102 1 0.28
VIR177692378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]400LVMQHLDNS DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 25 0.28
VIR177693378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]401VMQHLDNSI DRB1_1506 1 0.28
VIR177694378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]402MQHLDNSIT DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 6 0.28
VIR177701378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]409ITTFTKRGK DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 10 0.20
VIR177710378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]418LGIRWYSSK DRB1_0813 1 0.27
VIR177712378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]420IRWYSSKQG DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1506 12 0.29
VIR177715378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]423YSSKQGHGE DRB1_0801 1 0.30
VIR177728378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]436WIPIGNQVT DRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426 6 0.26
VIR177731378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]439IGNQVTRRI DRB1_0402, DRB1_0423, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 13 0.23
VIR177735378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]443VTRRIAAKI DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806 4 0.32
VIR177751378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]459WGELFNIPL DRB1_0101 1 0.28
VIR177755378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]463FNIPLTAHF DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305 12 0.34
VIR177768378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]476VIGDDPEHG DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0421, DRB1_1107 9 0.25
VIR177781378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]489YHRVYGYPT DRB1_0101, DRB5_0101, DRB5_0105 3 0.28
VIR177784378773195 YP 005172928.1 choDgeneproduct[MycobacteriumbovisBCGstr.Mexico]492VYGYPTLYV DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 22 0.21
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