VIRmiRNA | Resource for experimental viral miRNA and their targets

Result for your query miRNA sequence
>hsv1-miR-34208b
agugcuc

RED	=100 % Complementary sequence
.	=Identical residue
blue alphabets	=mismatch
_	=Gap

Acc number	miRNA	Start	Alignment	End	% Identity
Query		1	`agtgctc`	7
MIMAT0029049	gga-miR-7447-3p	8	`.......`	2	100
MIMAT0019173	bfl-miR-2072-3p	8	`.......`	2	100
MIMAT0007320	oan-miR-1419f-5p	1	`.......`	7	100
MIMAT0037028	ssc-miR-9810-3p	7	`_......`	2	85
MIMAT0036805	oha-miR-20b-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0036329	ocu-miR-520e	3	`......_`	8	85
MIMAT0036326	ocu-miR-294-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0036323	ocu-miR-302d-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0036321	ocu-miR-302a-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0036319	ocu-miR-302c-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0036317	ocu-miR-302b-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0034930	efu-miR-9282	3	`_......`	8	85
MIMAT0034895	efu-miR-9265	7	`_......`	2	85
MIMAT0034886	efu-miR-9189c	2	`_......`	7	85
MIMAT0034639	eca-miR-372	3	`......_`	8	85
MIMAT0034605	eca-miR-9060	7	`_......`	2	85
MIMAT0032807	cel-miR-8197-5p	1	`......_`	6	85
MIMAT0032747	ssa-miR-8160-3p	8	`......_`	3	85
MIMAT0032636	ssa-miR-430c-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0032634	ssa-miR-430b-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0032632	ssa-miR-430a-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0031641	bbe-miR-2072-3p	8	`_......`	3	85
MIMAT0030442	bta-miR-7862	3	`_......`	8	85
MIMAT0030363	hhi-miR-430b	3	`......_`	8	85
MIMAT0030341	hhi-miR-430a	3	`......_`	8	85
MIMAT0030330	bdi-miR7787-5p	1	`_......`	6	85
MIMAT0030301	bdi-miR7775-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0032227	lva-miR-2006-3p	6	`_......`	1	85
MIMAT0032180	pmi-miR-2006-3p	6	`_......`	1	85
MIMAT0028837	mdo-miR-7386b-3p	8	`_......`	3	85
MIMAT0026298	ccr-miR-430	3	`......_`	8	85
MIMAT0027833	mmu-miR-3547-3p	7	`_......`	2	85
MIMAT0025755	gga-miR-6654-3p	8	`......_`	3	85
MIMAT0025703	gga-miR-6608-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0022040	aca-miR-5420	3	`......_`	8	85
MIMAT0022010	aca-miR-5400	8	`......_`	3	85
MIMAT0021919	aca-miR-302b	3	`......_`	8	85
MIMAT0020514	dme-miR-4908-3p	3	`_......`	8	85
MIMAT0020512	dme-miR-4918-5p	8	`_......`	3	85
MIMAT0019552	pma-miR-430e	3	`......_`	8	85
MIMAT0019551	pma-miR-430d	3	`......_`	8	85
MIMAT0019550	pma-miR-430c	3	`......_`	8	85
MIMAT0019548	pma-miR-430a	3	`......_`	8	85
MIMAT0019541	pma-miR-430f	3	`......_`	8	85
MIMAT0019538	pma-miR-302	3	`......_`	8	85
MIMAT0019520	pma-miR-208-5p	1	`_......`	6	85
MIMAT0019000	hsa-miR-4473	3	`......_`	8	85
MIMAT0018179	hsa-miR-3907	3	`_......`	8	85
MIMAT0018085	hsa-miR-3663-3p	7	`_......`	2	85
MIMAT0016674	cin-miR-4094-5p	1	`_......`	6	85
MIMAT0016555	cin-miR-4033-5p	7	`_......`	2	85
MIMAT0016415	cin-miR-367-5p	1	`......_`	6	85
MIMAT0017802	rno-miR-3547	7	`_......`	2	85
MIMAT0015973	ppy-miR-520e	3	`......_`	8	85
MIMAT0015972	ppy-miR-520d-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0015970	ppy-miR-520c-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0015968	ppy-miR-520b	3	`......_`	8	85
MIMAT0015967	ppy-miR-520a-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0015861	ppy-miR-373	3	`......_`	8	85
MIMAT0015860	ppy-miR-372	3	`......_`	8	85
MIMAT0015819	ppy-miR-302d	3	`......_`	8	85
MIMAT0015818	ppy-miR-302c	3	`......_`	8	85
MIMAT0015817	ppy-miR-302b	3	`......_`	8	85
MIMAT0014936	mmu-miR-3102-3p	6	`_......`	1	85
MIMAT0014490	tgu-miR-2980	8	`......_`	3	85
MIMAT0014230	aae-miR-306-3p	8	`_......`	3	85
MIMAT0015315	zma-miR159k-5p	1	`_......`	6	85
MIMAT0015314	zma-miR159j-5p	1	`_......`	6	85
MIMAT0015313	zma-miR159i-5p	1	`_......`	6	85
MIMAT0015312	zma-miR159h-5p	1	`_......`	6	85
MIMAT0015311	zma-miR159g-5p	1	`_......`	6	85
MIMAT0013807	ola-miR-430d	3	`......_`	8	85
MIMAT0013806	ola-miR-430b	3	`......_`	8	85
MIMAT0013805	ola-miR-430c	3	`......_`	8	85
MIMAT0013804	ola-miR-430a	3	`......_`	8	85
MIMAT0013243	eca-miR-764-5p	2	`_......`	7	85
MIMAT0012914	eca-miR-302d	3	`......_`	8	85
MIMAT0012913	eca-miR-302c	3	`......_`	8	85
MIMAT0012912	eca-miR-302b	3	`......_`	8	85
MIMAT0012911	eca-miR-302a	3	`......_`	8	85
MIMAT0012854	rno-miR-764-5p	2	`_......`	7	85
MIMAT0012825	rno-miR-105	3	`......_`	8	85
MIMAT0012818	ptr-miR-764	2	`_......`	7	85
MIMAT0012794	mml-miR-764	2	`_......`	7	85
MIMAT0009948	bta-miR-764	2	`_......`	7	85
MIMAT0009937	cfa-miR-764	2	`_......`	7	85
MIMAT0009747	spu-miR-2006	6	`_......`	1	85
MIMAT0009433	mmu-miR-1960	3	`......_`	8	85
MIMAT0009281	bta-miR-302c	3	`......_`	8	85
MIMAT0009280	bta-miR-302b	3	`......_`	8	85
MIMAT0009279	bta-miR-302d	3	`......_`	8	85
MIMAT0008201	ptr-miR-520e	3	`......_`	8	85
MIMAT0008200	ptr-miR-520d	3	`......_`	8	85
MIMAT0008198	ptr-miR-520b	3	`......_`	8	85
MIMAT0008197	ptr-miR-520a	3	`......_`	8	85
MIMAT0008122	ptr-miR-372	3	`......_`	8	85
MIMAT0008090	ptr-miR-302e	3	`......_`	8	85
MIMAT0008089	ptr-miR-302d	3	`......_`	8	85
MIMAT0008088	ptr-miR-302c	3	`......_`	8	85
MIMAT0008087	ptr-miR-302b	3	`......_`	8	85
MIMAT0008086	ptr-miR-302a	3	`......_`	8	85
MIMAT0007777	osa-miR1855	6	`......_`	1	85
MIMAT0006749	cfa-miR-106a	3	`......_`	8	85
MIMAT0006388	mml-miR-520a-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0006384	mml-miR-519a-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0006378	mml-miR-518a-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0006299	mml-miR-373	3	`......_`	8	85
MIMAT0006298	mml-miR-372-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0006262	mml-miR-302d	3	`......_`	8	85
MIMAT0006261	mml-miR-302c	3	`......_`	8	85
MIMAT0006260	mml-miR-302b	3	`......_`	8	85
MIMAT0006259	mml-miR-302a-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0007587	gga-miR-1695	6	`_......`	1	85
MIMAT0007253	oan-miR-1419d-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0007240	oan-miR-1419b-5p	1	`......_`	6	85
MIMAT0007195	oan-miR-302-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0007110	oan-miR-1378	3	`......_`	8	85
MIMAT0006926	oan-miR-1420c-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0006923	oan-miR-1420a-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0005931	hsa-miR-302e	3	`......_`	8	85
MIMAT0005399	cre-miR1153-5p.2	1	`......_`	6	85
MIMAT0005241	smo-miR1088-3p	3	`_......`	8	85
MIMAT0004464	mdv2-miR-M21-3p	6	`_......`	1	85
MIMAT0004183	mdo-miR-302d	3	`......_`	8	85
MIMAT0004182	mdo-miR-302a	3	`......_`	8	85
MIMAT0004181	mdo-miR-302c	3	`......_`	8	85
MIMAT0004180	mdo-miR-302b	3	`......_`	8	85
MIMAT0004178	mdo-miR-93-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0003709	xtr-miR-428a	3	`......_`	8	85
MIMAT0003659	xtr-miR-93a	3	`......_`	8	85
MIMAT0003636	xtr-miR-302	3	`......_`	8	85
MIMAT0003894	mmu-miR-764-5p	2	`_......`	7	85
MIMAT0003377	mmu-miR-302d-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0003374	mmu-miR-302b-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0003360	gga-miR-302d	3	`......_`	8	85
MIMAT0003359	gga-miR-302c-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0003357	gga-miR-302b-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0002856	hsa-miR-520d-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0002846	hsa-miR-520c-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0002843	hsa-miR-520b	3	`......_`	8	85
MIMAT0002834	hsa-miR-520a-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0002825	hsa-miR-520e	3	`......_`	8	85
MIMAT0002781	mne-miR-93	3	`......_`	8	85
MIMAT0002778	lla-miR-93	3	`......_`	8	85
MIMAT0002776	sla-miR-93	3	`......_`	8	85
MIMAT0002773	mml-miR-93-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0002770	ptr-miR-93	3	`......_`	8	85
MIMAT0002767	ppy-miR-93	3	`......_`	8	85
MIMAT0002764	ppa-miR-93	3	`......_`	8	85
MIMAT0002762	age-miR-93	3	`......_`	8	85
MIMAT0002759	ggo-miR-93	3	`......_`	8	85
MIMAT0022906	ptc-miR172h-5p	7	`_......`	2	85
MIMAT0001880	dre-miR-430i-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0015177	zma-miR159b-5p	1	`_......`	6	85
MIMAT0001572	mghv-miR-M1-8-5p	6	`......_`	1	85
MIMAT0001425	dre-miR-430c-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0001424	dre-miR-430b-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0001423	dre-miR-430a-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0001345	xla-miR-428	3	`......_`	8	85
MIMAT0001344	xla-miR-427	3	`......_`	8	85
MIMAT0000895	rno-miR-291a-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0026485	hsa-miR-383-3p	8	`......_`	3	85
MIMAT0000726	hsa-miR-373-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000724	hsa-miR-372-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000718	hsa-miR-302d-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000717	hsa-miR-302c-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000715	hsa-miR-302b-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000684	hsa-miR-302a-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000380	mmu-miR-302a-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000373	mmu-miR-295-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000372	mmu-miR-294-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000368	mmu-miR-291a-3p	3	`......_`	8	85