VIRmiRNA | Resource for experimental viral miRNA and their targets

Result for your query miRNA sequence
>dev-miR-d16-3p
uaaacac

RED	=100 % Complementary sequence
.	=Identical residue
blue alphabets	=mismatch
_	=Gap

Acc number	miRNA	Start	Alignment	End	% Identity
Query		1	`taaacac`	7
MIMAT0035292	gsa-miR-124b-5p	7	`.......`	1	100
MIMAT0028853	mdo-miR-7386e-3p	2	`.......`	8	100
MIMAT0028271	mml-miR-7168-3p	8	`.......`	2	100
MIMAT0028189	dev-miR-D16-3p	2	`.......`	8	100
MIMAT0015794	ppy-miR-199b-5p	7	`.......`	1	100
MIMAT0012501	dsi-miR-975	1	`.......`	7	100
MIMAT0015257	cin-miR-124-2-5p	8	`.......`	2	100
MIMAT0005491	dme-miR-975-5p	1	`.......`	7	100
MIMAT0037151	ata-miR395b-3p	8	`_......`	3	85
MIMAT0036968	gra-miR827b	8	`......_`	3	85
MIMAT0036895	oha-miR-30d-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0036892	oha-miR-30c-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0036890	oha-miR-30b-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0036888	oha-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0036886	oha-miR-30e-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0036585	tch-miR-30c-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0036562	tch-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0036503	tch-miR-30b-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0036392	gma-miR9758	6	`......_`	1	85
MIMAT0036130	chi-miR-30f-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0036128	chi-miR-30e-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0036125	chi-miR-30c-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0036123	chi-miR-30b-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0036121	chi-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0035693	bra-miR9567-5p	1	`......_`	6	85
MIMAT0035192	efu-miR-30b	3	`......_`	8	85
MIMAT0034264	gra-miR8639e	1	`......_`	6	85
MIMAT0034263	gra-miR8639d	1	`......_`	6	85
MIMAT0033995	gra-miR8639i	1	`......_`	6	85
MIMAT0033994	gra-miR8639h	1	`......_`	6	85
MIMAT0033993	gra-miR8639g	1	`......_`	6	85
MIMAT0033992	gra-miR8639f	1	`......_`	6	85
MIMAT0033991	gra-miR8639c	1	`......_`	6	85
MIMAT0033990	gra-miR8639b	1	`......_`	6	85
MIMAT0033989	gra-miR8639a	1	`......_`	6	85
MIMAT0033525	sma-miR-8410-3p	7	`_......`	2	85
MIMAT0033115	ppc-miR-8299-5p	8	`_......`	3	85
MIMAT0032611	ssa-miR-30e-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0032608	ssa-miR-30d-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0032606	ssa-miR-30c-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0032604	ssa-miR-30b-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0032600	ssa-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0032362	ssa-miR-142a-3p	7	`_......`	2	85
MIMAT0031530	ppe-miR7122b-3p	8	`_......`	3	85
MIMAT0030059	oar-miR-30d	3	`......_`	8	85
MIMAT0030058	oar-miR-30c	3	`......_`	8	85
MIMAT0030057	oar-miR-30b	3	`......_`	8	85
MIMAT0030055	oar-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0029657	cbn-miR-7618	3	`_......`	8	85
MIMAT0029498	ipu-miR-30c	3	`......_`	8	85
MIMAT0029497	ipu-miR-30b	3	`......_`	8	85
MIMAT0029354	lja-miR7531	7	`_......`	2	85
MIMAT0029026	oan-miR-7436-5p	8	`_......`	3	85
MIMAT0028987	oan-miR-7419-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0028847	mdo-miR-7386j-3p	3	`......_`	8	85
MIMAT0028648	mdo-miR-7324-5p	1	`_......`	6	85
MIMAT0028622	mdo-miR-30d-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0028550	mdo-miR-30b-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0028502	mdo-miR-30c-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0026290	ccr-miR-30d	3	`......_`	8	85
MIMAT0026289	ccr-miR-30b	3	`......_`	8	85
MIMAT0027767	mmu-miR-6933-3p	8	`_......`	3	85
MIMAT0025411	tgu-miR-30e	3	`......_`	8	85
MIMAT0024124	ggo-miR-30e	3	`......_`	8	85
MIMAT0024111	ggo-miR-30c	3	`......_`	8	85
MIMAT0023948	cgr-miR-384-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0023900	cgr-miR-30e-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0023898	cgr-miR-30c	3	`......_`	8	85
MIMAT0023896	cgr-miR-30b-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0023894	cgr-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0023497	hco-miR-5985	1	`_......`	6	85
MIMAT0023491	hco-miR-5981	6	`......_`	1	85
MIMAT0023487	hco-miR-5977	8	`......_`	3	85
MIMAT0022808	sha-miR-30c	3	`......_`	8	85
MIMAT0022807	sha-miR-30e	3	`......_`	8	85
MIMAT0022666	ola-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0022599	ola-miR-30d-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0022598	ola-miR-30c	3	`......_`	8	85
MIMAT0021928	aca-miR-30e-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0021926	aca-miR-30d-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0021924	aca-miR-30c-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0021922	aca-miR-30b-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0021920	aca-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0020723	bdi-miR395d-3p	8	`_......`	3	85
MIMAT0032121	gma-miR5035-3p	6	`......_`	1	85
MIMAT0019877	hsa-miR-3591-3p	1	`_......`	6	85
MIMAT0019628	pma-miR-4595	8	`_......`	3	85
MIMAT0019609	pma-miR-4576	8	`......_`	3	85
MIMAT0019431	pma-miR-30g	3	`......_`	8	85
MIMAT0019430	pma-miR-30f	3	`......_`	8	85
MIMAT0019428	pma-miR-30e-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0019427	pma-miR-30d	3	`......_`	8	85
MIMAT0019425	pma-miR-30c-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0019424	pma-miR-30b	3	`......_`	8	85
MIMAT0019422	pma-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0018547	ame-miR-3771	3	`_......`	8	85
MIMAT0018133	pab-miR3701	1	`......_`	6	85
MIMAT0016823	cin-miR-4203-3p	1	`......_`	6	85
MIMAT0016641	cin-miR-4076-3p	7	`_......`	2	85
MIMAT0015739	ppy-miR-30e	3	`......_`	8	85
MIMAT0015738	ppy-miR-30d	3	`......_`	8	85
MIMAT0015737	ppy-miR-30c	3	`......_`	8	85
MIMAT0015736	ppy-miR-30b	3	`......_`	8	85
MIMAT0015492	bmo-miR-3304a	1	`......_`	6	85
MIMAT0015457	bmo-miR-3272	1	`......_`	6	85
MIMAT0015453	bmo-miR-3268-3p	6	`_......`	1	85
MIMAT0014657	tgu-miR-30d-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0014637	tgu-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0014521	tgu-miR-30c-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0014506	tgu-miR-30b-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0013872	ssc-miR-30e-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0013871	ssc-miR-30d	3	`......_`	8	85
MIMAT0013006	eca-miR-30d	3	`......_`	8	85
MIMAT0013005	eca-miR-30b	3	`......_`	8	85
MIMAT0012916	eca-miR-30e	3	`......_`	8	85
MIMAT0012915	eca-miR-30c	3	`......_`	8	85
MIMAT0012873	hvt-miR-H17-3p	1	`......_`	6	85
MIMAT0010193	ssc-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0009282	bta-miR-30f	3	`......_`	8	85
MIMAT0008092	ptr-miR-30e	3	`......_`	8	85
MIMAT0007836	osa-miR1879	6	`_......`	1	85
MIMAT0007756	ssc-miR-30b-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0006617	cfa-miR-30b	3	`......_`	8	85
MIMAT0006616	cfa-miR-30d	3	`......_`	8	85
MIMAT0006605	cfa-miR-30c	3	`......_`	8	85
MIMAT0006604	cfa-miR-30a	3	`......_`	8	85
MIMAT0006172	mml-miR-30e-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0006171	mml-miR-30d-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0006170	mml-miR-30c-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0007203	oan-miR-30e-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0007043	oan-miR-30b-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0007041	oan-miR-30d-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0007037	oan-miR-30f	3	`......_`	8	85
MIMAT0006913	oan-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0006911	oan-miR-30c-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0005309	rno-miR-384-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0004454	mdv2-miR-M15-3p	7	`_......`	2	85
MIMAT0020850	dme-miR-956-5p	6	`_......`	1	85
MIMAT0004093	mdo-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0003941	ath-miR782	3	`_......`	8	85
MIMAT0003850	bta-miR-30c	3	`......_`	8	85
MIMAT0003841	bta-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0003799	bta-miR-30e-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0003791	bta-miR-142-3p	7	`_......`	2	85
MIMAT0003678	xtr-miR-30e	3	`......_`	8	85
MIMAT0003657	xtr-miR-30d	3	`......_`	8	85
MIMAT0003577	xtr-miR-30c	3	`......_`	8	85
MIMAT0003576	xtr-miR-30b	3	`......_`	8	85
MIMAT0003574	xtr-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0003547	bta-miR-30b-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0003533	bta-miR-30d	3	`......_`	8	85
MIMAT0003023	tni-miR-30c	3	`......_`	8	85
MIMAT0003022	fru-miR-30c	3	`......_`	8	85
MIMAT0002950	tni-miR-30d	3	`......_`	8	85
MIMAT0002949	fru-miR-30d	3	`......_`	8	85
MIMAT0002948	tni-miR-30b	3	`......_`	8	85
MIMAT0002947	fru-miR-30b	3	`......_`	8	85
MIMAT0002620	ppa-miR-30d	3	`......_`	8	85
MIMAT0002619	mne-miR-30d	3	`......_`	8	85
MIMAT0002618	ggo-miR-30d	3	`......_`	8	85
MIMAT0002617	ptr-miR-30d	3	`......_`	8	85
MIMAT0002616	mne-miR-30c	3	`......_`	8	85
MIMAT0002615	lla-miR-30c	3	`......_`	8	85
MIMAT0002614	ptr-miR-30c	3	`......_`	8	85
MIMAT0002377	ppa-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0002375	ppy-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0002373	ggo-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0002371	ptr-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0002369	mml-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0002219	ppa-miR-30b	3	`......_`	8	85
MIMAT0002218	age-miR-30b	3	`......_`	8	85
MIMAT0002217	mne-miR-30b	3	`......_`	8	85
MIMAT0002216	lla-miR-30b	3	`......_`	8	85
MIMAT0002215	ggo-miR-30b	3	`......_`	8	85
MIMAT0002214	ptr-miR-30b	3	`......_`	8	85
MIMAT0002213	mml-miR-30b-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0002167	ssc-miR-30c-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0001807	dre-miR-30e-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0001806	dre-miR-30d	3	`......_`	8	85
MIMAT0001805	dre-miR-30c-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0001804	dre-miR-30b	3	`......_`	8	85
MIMAT0001803	dre-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0001177	gga-miR-30e-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0001137	gga-miR-30c-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0001135	gga-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0001130	gga-miR-30b-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0001129	gga-miR-30d	3	`......_`	8	85
MIMAT0004745	mmu-miR-384-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000808	rno-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000807	rno-miR-30d-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000806	rno-miR-30b-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000805	rno-miR-30e-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000804	rno-miR-30c-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000692	hsa-miR-30e-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000515	mmu-miR-30d-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000514	mmu-miR-30c-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000420	hsa-miR-30b-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000248	mmu-miR-30e-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000245	hsa-miR-30d-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000244	hsa-miR-30c-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000130	mmu-miR-30b-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000128	mmu-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85
MIMAT0000087	hsa-miR-30a-5p	3	`......_`	8	85