Result for your query miRNA sequence
>ebv-miR-bart20-5p
uagcaggc

RED =100 % Complementary sequence
.=Identical residue
blue alphabets=mismatch
_=Gap


Acc numbermiRNAStartAlignmentEnd% Identity
Query1tagcaggc8
MIMAT0003719ebv-miR-BART20-5p1........8100
MIMAT0034931efu-miR-3707_.......187
MIMAT0032554ssa-miR-24a-4-5p8_.......287
MIMAT0025638gga-miR-6566-3p2_.......887
MIMAT0025373ssc-miR-3707_.......187
MIMAT0025093mmu-miR-63501......._787
MIMAT0025089mmu-miR-63461......._787
MIMAT0024182ggo-miR-3707_.......187
MIMAT0021214mtr-miR5229b2......._887
MIMAT0021213mtr-miR5229a2......._887
MIMAT0019779hsa-miR-4690-5p2_.......887
MIMAT0019244oar-miR-370-3p7_.......187
MIMAT0017967ssc-miR-12718_.......287
MIMAT0016453cin-miR-4001d-3p7_.......187
MIMAT0015857ppy-miR-3707_.......187
MIMAT0014494tgu-miR-2984-5p8_.......287
MIMAT0013142eca-miR-3707_.......187
MIMAT0009889cfa-miR-3707_.......187
MIMAT0009300bta-miR-3707_.......187
MIMAT0008120ptr-miR-3707_.......187
MIMAT0026860mml-miR-374b-3p2......._887
MIMAT0006295mml-miR-370-3p7_.......187
MIMAT0003447rlcv-miR-rL1-16-5p2_.......887
MIMAT0003122rno-miR-370-3p7_.......187
MIMAT0001095mmu-miR-370-3p7_.......187
MIMAT0000722hsa-miR-370-3p7_.......187
MIMAT0003467mmu-miR-6881.c......887
MIMAT0036746oha-miR-16b-5p1......__675
MIMAT0036744oha-miR-16a-5p1......__675
MIMAT0036742oha-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0036740oha-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0036561tch-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0036552tch-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0036549tch-miR-195-5p1......__675
MIMAT0036030chi-miR-195-5p1......__675
MIMAT0035996chi-miR-16b-5p1......__675
MIMAT0035994chi-miR-16a-5p1......__675
MIMAT0035992chi-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0035990chi-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0035776tae-miR9665-3p3......__875
MIMAT0035728rno-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0035565dvi-miR-252-3p6_......_175
MIMAT0035316gsa-miR-153-5p6_......_175
MIMAT0035188efu-miR-151......__675
MIMAT0035087efu-miR-161......__675
MIMAT0034564eca-miR-90222_......_775
MIMAT0034304cfa-miR-88142......__775
MIMAT0034267gra-miR7502f3......__875
MIMAT0034065gra-miR86921_......_675
MIMAT0033355str-miR-86-3p6_......_175
MIMAT0033247ppc-miR-8349-3p6......__175
MIMAT0032645ssa-miR-456-5p1__......675
MIMAT0032410ssa-miR-16c-5p1......__675
MIMAT0032408ssa-miR-16b-5p1......__675
MIMAT0032405ssa-miR-16a-5p1......__675
MIMAT0032401ssa-miR-15d-5p1......__675
MIMAT0032398ssa-miR-15c-5p1......__675
MIMAT0032396ssa-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0032394ssa-miR-15a-5p3......__875
MIMAT0031758bma-miR-53662......__775
MIMAT0030366hhi-miR-15a1......__675
MIMAT0030319bdi-miR7782-3p7_......_275
MIMAT0030036oar-miR-16b1......__675
MIMAT0029577ipu-miR-457b1......__675
MIMAT0029564ipu-miR-75658_......_375
MIMAT0029466ipu-miR-2143_......_875
MIMAT0029432ipu-miR-16b1......__675
MIMAT0029431ipu-miR-15b1......__675
MIMAT0029430ipu-miR-15a1......__675
MIMAT0031144aja-miR-2143_......_875
MIMAT0028569mdo-miR-7292-3p6......__175
MIMAT0026235ccr-miR-16c1......__675
MIMAT0026234ccr-miR-16b1......__675
MIMAT0026233ccr-miR-16a1......__675
MIMAT0026232ccr-miR-15b1......__675
MIMAT0026228ccr-miR-15a1......__675
MIMAT0027939mmu-miR-7017-3p8_......_375
MIMAT0027689hsa-miR-6894-3p8__......375
MIMAT0027687hsa-miR-6893-3p7_......_275
MIMAT0027522hsa-miR-6811-5p3__......875
MIMAT0025847hsa-miR-6511b-5p3__......875
MIMAT0025756gga-miR-6655-5p7......__275
MIMAT0025557bta-miR-503-5p1......__675
MIMAT0025537bta-miR-65191......__675
MIMAT0025476hsa-miR-6510-5p2_......_775
MIMAT0025096mmu-miR-63531......__675
MIMAT0025076mmu-miR-195b1......__675
MIMAT0025067rno-miR-63288__......375
MIMAT0024782hsa-miR-61652_......_775
MIMAT0024625mml-miR-61321_......_675
MIMAT0024616hsa-miR-61321_......_675
MIMAT0024606ptr-miR-61321_......_675
MIMAT0027108mml-miR-1271-3p8__......375
MIMAT0024203ggo-miR-5031......__675
MIMAT0023829cgr-miR-1951......__675
MIMAT0023793cgr-miR-16-5p1......__675
MIMAT0023791cgr-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0023789cgr-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0023747cgr-miR-12718__......375
MIMAT0022650ola-miR-15a1......__675
MIMAT0022613ola-miR-161......__675
MIMAT0022448meu-miR-16c1......__675
MIMAT0022447meu-miR-15c1......__675
MIMAT0022255hsa-miR-4524b-5p2......__775
MIMAT0021872aca-miR-214-3p3_......_875
MIMAT0021801aca-miR-16b-5p1......__675
MIMAT0021799aca-miR-16a-5p1......__675
MIMAT0021792aca-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0021790aca-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0021595asu-miR-5366-3p2......__775
MIMAT0021510asu-miR-252-3p7_......_275
MIMAT0022748xtr-miR-449c-3p8......__375
MIMAT0019912hsa-miR-4763-5p7__......275
MIMAT0019381pma-miR-16-5p1......__675
MIMAT0019380pma-miR-15b1......__675
MIMAT0019379pma-miR-15a1......__675
MIMAT0019062hsa-miR-4524a-5p2......__775
MIMAT0018805tca-miR-252a-3p6_......_175
MIMAT0018121hsa-miR-3692-5p6_......_175
MIMAT0018087hsa-miR-36651_......_675
MIMAT0017999hsa-miR-3619-5p3_......_875
MIMAT0016897hsa-miR-42691__......675
MIMAT0016742cin-miR-4142-5p1......__675
MIMAT0016612cin-miR-4062-5p7__......275
MIMAT0016606cin-miR-4059-5p1......__675
MIMAT0016397cin-miR-15-5p1......__675
MIMAT0016038ppy-miR-5968__......375
MIMAT0015926ppy-miR-5031......__675
MIMAT0015790ppy-miR-1951......__675
MIMAT0017693aly-miR853-5p6......__175
MIMAT0014619tgu-miR-15c-5p1......__675
MIMAT0014603tgu-miR-214-3p3_......_875
MIMAT0014597tgu-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0014588tgu-miR-16b-5p1......__675
MIMAT0014586tgu-miR-16c1......__675
MIMAT0014583tgu-miR-16a-5p1......__675
MIMAT0014555tgu-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0026964tgu-miR-456-5p1__......675
MIMAT0014374cqu-miR-252-3p6_......_175
MIMAT0015328zma-miR169q-3p2__......775
MIMAT0015325zma-miR169n-3p2__......775
MIMAT0013928ssc-miR-1951......__675
MIMAT0013853bta-miR-28956_......_175
MIMAT0013227eca-miR-5031......__675
MIMAT0013083eca-miR-15a1......__675
MIMAT0013027eca-miR-1951......__675
MIMAT0012963eca-miR-2143_......_875
MIMAT0012955eca-miR-161......__675
MIMAT0012954eca-miR-15b1......__675
MIMAT0012923eca-miR-7613_......_875
MIMAT0012853rno-miR-7613_......_875
MIMAT0012817ptr-miR-7613_......_875
MIMAT0012807ptr-miR-5968__......375
MIMAT0012793mml-miR-7613_......_875
MIMAT0012768mdo-miR-7613_......_875
MIMAT0012760mdo-miR-1951......__675
MIMAT0012466dsi-miR-252-3p7_......_275
MIMAT0012262dps-miR-252-3p7_......_275
MIMAT0012017bta-miR-24423_......_875
MIMAT0011889bta-miR-23538__......375
MIMAT0011793bta-miR-22863_......_875
MIMAT0011205gga-miR-21292_......_775
MIMAT0010189ssc-miR-5031......__675
MIMAT0015293bmo-miR-252-3p6_......_175
MIMAT0009986bfl-miR-20603_......_875
MIMAT0009936cfa-miR-7613_......_875
MIMAT0009847cfa-miR-2143_......_875
MIMAT0009373bta-miR-7613_......_875
MIMAT0009242bta-miR-16a1......__675
MIMAT0008176ptr-miR-5031......__675
MIMAT0008060ptr-miR-1951......__675
MIMAT0011140xla-miR-15c1......__675
MIMAT0007754ssc-miR-161......__675
MIMAT0007753ssc-miR-15a1......__675
MIMAT0007751gga-miR-2143_......_875
MIMAT0006746cfa-miR-5031......__675
MIMAT0006692cfa-miR-1951......__675
MIMAT0006676cfa-miR-15b1......__675
MIMAT0006648cfa-miR-161......__675
MIMAT0006647cfa-miR-15a1......__675
MIMAT0006367mml-miR-503-5p1......__675
MIMAT0006228mml-miR-195-5p1......__675
MIMAT0007739gga-miR-16c-5p1......__675
MIMAT0007737gga-miR-15c-5p1......__675
MIMAT0007685gga-miR-17748_......_375
MIMAT0007542gga-miR-16611......__675
MIMAT0007491gga-miR-16231__......675
MIMAT0007413gga-miR-15562__......775
MIMAT0007405gga-miR-1551-5p2......__775
MIMAT0006049odi-miR-14961......__675
MIMAT0007305oan-miR-1421ai-5p1_......_675
MIMAT0007245oan-miR-1421z-5p1_......_675
MIMAT0007171oan-miR-214-3p3_......_875
MIMAT0007166oan-miR-16a-5p1......__675
MIMAT0007164oan-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0007052oan-miR-16b-5p1......__675
MIMAT0007050oan-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0006847oan-miR-16c-5p1......__675
MIMAT0006845oan-miR-15c-5p1......__675
MIMAT0005548mcmv-miR-m59-12......__775
MIMAT0020896dme-miR-252-3p7_......_275
MIMAT0004956hsa-miR-374b-3p3......__875
MIMAT0004335bta-miR-1951......__675
MIMAT0004334bta-miR-15a1......__675
MIMAT0004145mdo-miR-16-5p1......__675
MIMAT0004144mdo-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0004130mdo-miR-214-3p3_......_875
MIMAT0012115sme-miR-133b-5p8......__375
MIMAT0004218ath-miR780.13......__875
MIMAT0003938ath-miR779.18......__375
MIMAT0003825bta-miR-2143_......_875
MIMAT0003792bta-miR-15b1......__675
MIMAT0003668xtr-miR-16b1......__675
MIMAT0003651xtr-miR-15c1......__675
MIMAT0003627xtr-miR-2143_......_875
MIMAT0003563xtr-miR-16a1......__675
MIMAT0003562xtr-miR-16c1......__675
MIMAT0003561xtr-miR-15b1......__675
MIMAT0003560xtr-miR-15a1......__675
MIMAT0003525bta-miR-16b1......__675
MIMAT0003461mmu-miR-6836_......_175
MIMAT0003893mmu-miR-7613_......_875
MIMAT0010364hsa-miR-7613_......_875
MIMAT0003264hsa-miR-5968__......375
MIMAT0003213rno-miR-503-5p1......__675
MIMAT0003188mmu-miR-503-5p1......__675
MIMAT0003108tni-miR-161......__675
MIMAT0003107fru-miR-161......__675
MIMAT0003106tni-miR-15a1......__675
MIMAT0003105fru-miR-15a1......__675
MIMAT0003086tni-miR-15b1......__675
MIMAT0003085fru-miR-15b1......__675
MIMAT0003027tni-miR-2143_......_875
MIMAT0003026fru-miR-2143_......_875
MIMAT0002874hsa-miR-503-5p1......__675
MIMAT0002657lla-miR-161......__675
MIMAT0002656lla-miR-15a1......__675
MIMAT0002655ptr-miR-161......__675
MIMAT0002654ptr-miR-15a1......__675
MIMAT0002653ppy-miR-161......__675
MIMAT0002652ppy-miR-15a1......__675
MIMAT0002651mml-miR-16-5p1......__675
MIMAT0026593mml-miR-15a-3p1__......675
MIMAT0002650mml-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0002649lca-miR-161......__675
MIMAT0002648lca-miR-15a1......__675
MIMAT0002647ppa-miR-161......__675
MIMAT0002646ppa-miR-15a1......__675
MIMAT0002645sla-miR-161......__675
MIMAT0002644sla-miR-15a1......__675
MIMAT0002643mne-miR-161......__675
MIMAT0002642mne-miR-15a1......__675
MIMAT0002641ggo-miR-161......__675
MIMAT0002640ggo-miR-15a1......__675
MIMAT0002639age-miR-161......__675
MIMAT0002638age-miR-15a1......__675
MIMAT0002557mne-miR-2143_......_875
MIMAT0002556sla-miR-2143_......_875
MIMAT0002555mml-miR-214-3p3_......_875
MIMAT0002554ptr-miR-2143_......_875
MIMAT0002553ppy-miR-2143_......_875
MIMAT0002552ppa-miR-2143_......_875
MIMAT0002551age-miR-2143_......_875
MIMAT0002550ggo-miR-2143_......_875
MIMAT0002317ppa-miR-1951......__675
MIMAT0002316ggo-miR-1951......__675
MIMAT0002209mne-miR-15b1......__675
MIMAT0002208lla-miR-15b1......__675
MIMAT0002207mml-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0002206ptr-miR-15b1......__675
MIMAT0002205ppy-miR-15b1......__675
MIMAT0002204ppa-miR-15b1......__675
MIMAT0002203age-miR-15b1......__675
MIMAT0002202ggo-miR-15b1......__675
MIMAT0002147ssc-miR-2143_......_875
MIMAT0002125ssc-miR-15b1......__675
MIMAT0001776dre-miR-16c-5p1......__675
MIMAT0001775dre-miR-16b1......__675
MIMAT0001774dre-miR-16a1......__675
MIMAT0001773dre-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0001772dre-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0001283dre-miR-2143_......_875
MIMAT0001154gga-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0001117gga-miR-15a1......__675
MIMAT0001116gga-miR-16-5p1......__675
MIMAT0000885rno-miR-214-3p3_......_875
MIMAT0000870rno-miR-195-5p1......__675
MIMAT0000785rno-miR-16-5p1......__675
MIMAT0000784rno-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0000661mmu-miR-214-3p3_......_875
MIMAT0000527mmu-miR-16-5p1......__675
MIMAT0000526mmu-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0000461hsa-miR-195-5p1......__675
MIMAT0000417hsa-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0000271hsa-miR-214-3p3_......_875
MIMAT0000225mmu-miR-195a-5p1......__675
MIMAT0000124mmu-miR-15b-5p1......__675
MIMAT0000069hsa-miR-16-5p1......__675
MIMAT0000068hsa-miR-15a-5p1......__675
MIMAT0015106cel-miR-65-3p6......__175