VMR_ID | miRNA | Virus | miRNA_Seq | Length | GC | Seed analysis miRBase |
Seed analysis VIRmiRNA |
Experimental Method | Target (if any) |
PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VMR_ID | miRNA | Virus | miRNA_Seq | Length | GC | Seed analysis miRBase |
Seed analysis VIRmiRNA |
Experimental Method | Target (if any) |
PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0001 | bfv-miR-bf1-3p | BFV | ucccugaagccauauccgaggcu | 23 |
|
| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0002 | bfv-miR-bf1-3p | BFV | ucccugaagccauauccgaggca | 23 |
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| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0003 | bfv-miR-bf1-3p | BFV | ucccugaagccauauccgaggc | 22 |
|
| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0004 | bfv-miR-bf1-3p | BFV | ucccugaagccauauccgaggu | 22 |
|
| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0005 | bfv-miR-bf1-3p | BFV | ucccugaagccauauccgagg | 21 |
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| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0010 | bfv-miR-bf2-3p | BFV | ccaggcgguaugcuuucuacuuuu | 24 |
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| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0011 | bfv-miR-bf2-3p | BFV | ucaggcgguaugcuuucuacuuu | 23 |
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| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0012 | bfv-miR-bf2-3p | BFV | ccaggcgguaugcuuucuacuu | 22 |
|
| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0013 | bfv-miR-bf2-3p | BFV | ccaggcgguaugcuuucuacu | 21 |
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| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0014 | bfv-miR-bf2-3p | BFV | ucaggcgguaugcuuucuacu | 21 |
|
| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0015 | bfv-miR-bf2-3p | BFV | ccaggcgguaugcuuucuac | 20 |
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| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0006 | bfv-miR-bf1-5p | BFV | uucggaggauggcucaucaagcu | 23 |
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| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0007 | bfv-miR-bf1-5p | BFV | uucggaggauggcucaucaagcc | 23 |
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| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0008 | bfv-miR-bf1-5p | BFV | uucggaggauggcucaucaagc | 22 |
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| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0009 | bfv-miR-bf1-5p | BFV | uucggaggauggcucaucaag | 21 |
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| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0016 | bfv-miR-bf2-5p | BFV | ucaguagaaagacaguaccucgccugu | 27 |
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| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0017 | bfv-miR-bf2-5p | BFV | ucaguagaaagacaguaccucgccu | 25 |
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| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0018 | bfv-miR-bf2-5p | BFV | ucaguagaaagacaguaccucgccc | 25 |
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| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0019 | bfv-miR-bf2-5p | BFV | ucaguagaaagacaguaccucgcc | 24 |
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| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0020 | bfv-miR-bf2-5p | BFV | ucaguagaaagacaguaccucgc | 23 |
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| Northern blot analysis, RT-PCR | Expt. Pred. |