Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
VIR006643339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]111LYPANSVPQDRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426 8
VIR006652339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]120VVRRINNALDRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 11
VIR006653339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]121VRRINNALQDRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB5_0101, DRB5_0105 34
VIR006656339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]124INNALQRADDRB1_1304 1
VIR006660339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]128LQRADQIAKDRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_0105 6
VIR006682339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]150IVADGEAGFDRB1_0301, DRB1_0309 2
VIR006690339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]158FGGALNVYEDRB1_0405 1
VIR006694339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]162LNVYELQKADRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1501, DRB1_1506 6
VIR006696339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]164VYELQKALIDRB1_1307 1
VIR006697339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]165YELQKALIADRB1_0101, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1321, DRB1_1323 13
VIR006703339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]171LIAAGVAGSDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 38
VIR006731339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]199LIPTQQHIRDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR006738339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]206IRTLTSARLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1501, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 26
VIR006756339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]224VVIARTDAEDRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0806, DRB1_1107, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328 21
VIR006790339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]258FYRTKNGIEDRB1_0405 1
VIR006791339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]259YRTKNGIEPDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817 4
VIR006797339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]265IEPCIARAKDRB1_0402, DRB5_0101, DRB5_0105 3
VIR006813339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]281LIWMETGTPDRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 4
VIR006815339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]283WMETGTPDLDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR006833339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]301VKAEYPDQMDRB1_0421 1
VIR006841339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]309MLAYNCSPSDRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1501, DRB1_1506 8
VIR006844339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]312YNCSPSFNWDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR006850339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]318FNWKKHLDDDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1321 5
VIR006864339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]332FQKELAAMGDRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426 3
VIR006873339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]341FKFQFITLADRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0813, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 13
VIR006875339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]343FQFITLAGFDRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0421, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_1101, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_0105 16
VIR006877339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]345FITLAGFHADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1307, DRB1_1323, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 9
VIR006880339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]348LAGFHALNYDRB1_1501, DRB1_1506 2
VIR006888339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]356YSMFDLAYGDRB1_0801, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1307 4
VIR006895339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]363YGYAQNQMSDRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426 8
VIR006906339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]374VELQEREFADRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311 4
VIR006934339630536 YP 004722178.1 isocitratelyase[MycobacteriumafricanumGM041182]402FDRIATTVDDRB1_0405, DRB1_0410 2
VIR006961339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]9FGNVQAHYDDRB1_0405, DRB1_1321 2
VIR006975339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]23FRLFLDPTQDRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1502 7
VIR006977339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]25LFLDPTQTYDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107 11
VIR006990339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]38FERDDMTLQDRB1_0305, DRB1_0401 2
VIR006995339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]43MTLQEAQIADRB1_0101, DRB1_0102 2
VIR007012339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]60LNLEPGMTLDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0703, DRB1_1501, DRB1_1506 5
VIR007027339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]75WGATMRRAIDRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 6
VIR007035339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]83IEKYDVNVVDRB1_0813, DRB1_1501, DRB1_1506 3
VIR007040339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]88VNVVGLTLSDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0404, DRB1_0423, DRB1_0813, DRB1_1107 8
VIR007042339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]90VVGLTLSENDRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0806, DRB1_1304 4
VIR007043339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]91VGLTLSENQDRB1_0401, DRB1_0426 2
VIR007045339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]93LTLSENQAGDRB1_0421 1
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VIR007059339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]107FDQMDTPRSDRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_1101 4
VIR007070339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]118VLLEGWEKFDRB1_0421 1
VIR007072339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]120LEGWEKFDEDRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1327, DRB1_1328 4
VIR007085339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]133IVSIGAFEHDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 30
VIR007088339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]136IGAFEHFGHDRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322 4
VIR007105339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]153VTHRTLPADDRB1_0806 1
VIR007110339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]158LPADGKMLLDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1107 8
VIR007116339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]164MLLHTIVRPDRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 12
VIR007117339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]165LLHTIVRPTDRB1_0402 1
VIR007118339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]166LHTIVRPTFDRB1_0301, DRB1_0309, DRB1_1128, DRB1_1305 4
VIR007122339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]170VRPTFKEGRDRB1_0301 1
VIR007140339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]188LVHFTKFILDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 33
VIR007143339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]191FTKFILAEIDRB1_1502 1
VIR007146339630539 YP 004722181.1 mycolicacidsynthase[MycobacteriumafricanumGM041182]194FILAEIFPGDRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0405, DRB1_0801, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 19
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