Browse Epitopes

This module is created to browse the epitopes predicted from vaccine candidates of all mycobacterial strains. This epitopes were predicted by creating 9mer overlapping peptides from the vaccine candidates from each mycobacterial species. We used a prediction pipeline for predicting the epitopes. Currently, you are browsing B cell epitopes from our compiled results. Here, the first column represent the unique Mtbeveb ID for each peptide sequences. The ID and peptide sequence is hyperlinked to epitope card. The next column contains Gene ID, which is hyperlinked to antigen card. The next column displays the detail of protien from NCBI notation. The fourth column presents the position of the peptide in that protein. This pipeline have the package for predicting linear B cell epitopes using LBtope, promiscous binder of MHC class I (Propred1) and MHC class II (Propred), CTL epitope (CTLpred), interferon-gamma inducing peptides (IFNepitope) and Interleukine 4 inducing peptides (IL4pred). The peptides can sorted at any header. The last three column present the field related to MHC class II prediction using Propred. The second last tells us the MHC class II alleles to which peptide is binding. The last column counts the number of MHC class II alleles for that peptide.


Total number of predicted 9mer peptides are 262824 (corresponding to browse type mhcII)



ID gene ID Protein Detail Position Sequence (9mer) MHC class II Alleles MHC class II alleles (count)
VIR020616339631796 YP 004723438.1 Ser/ThrproteinkinaseE[MycobacteriumafricanumGM041182]552VVNYQDPSWDRB1_1501, DRB1_1506 2
VIR020617339631796 YP 004723438.1 Ser/ThrproteinkinaseE[MycobacteriumafricanumGM041182]553VNYQDPSWLDRB1_0101, DRB1_0102 2
VIR020623339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]1MRLEVRQENDRB1_0806, DRB1_1304 2
VIR020627339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]5VRQENTAVSDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 32
VIR020639339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]17IGGVSRREFDRB1_1301, DRB1_1327, DRB1_1328 3
VIR020647339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]25FLAKVAAGGDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1120, DRB1_1302 7
VIR020659339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]37LMSFAGPVIDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 5
VIR020686339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]64FVFFMQENRDRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 8
VIR020687339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]65VFFMQENRSDRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1322 7
VIR020688339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]66FFMQENRSFDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 17
VIR020700339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]78FGTLSGTDGDRB1_0101 1
VIR020709339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]87FNTVSPLFQDRB1_0305, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 19
VIR020716339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]94FQQKGWNPMDRB1_0813 1
VIR020721339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]99WNPMTQALDDRB1_0405, DRB1_0801, DRB1_0817, DRB1_1321 4
VIR020733339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]111VTMPYRFDTDRB1_1501, DRB1_1506 2
VIR020737339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]115YRFDTTRGPDRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323 18
VIR020759339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]137WVAMHESWNDRB1_0405 1
VIR020760339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]138VAMHESWNGDRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 10
VIR020774339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]152WLPAQAKTRDRB5_0101, DRB5_0105 2
VIR020790339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]168VMGYYTRQDDRB1_0402, DRB1_0410, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328 16
VIR020791339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]169MGYYTRQDIDRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 14
VIR020794339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]172YTRQDIPIHDRB1_0305, DRB1_1114, DRB1_1321, DRB1_1323 4
VIR020799339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]177IPIHYLLADDRB1_1304 1
VIR020803339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]181YLLADAFTVDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0408, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323, DRB1_1502, DRB5_0101, DRB5_0105 14
VIR020809339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]187FTVCDRYFCDRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1323 3
VIR020816339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]194FCSVLGPTLDRB1_0101 1
VIR020820339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]198LGPTLPNRLDRB1_0701, DRB1_0703 2
VIR020828339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]206LYWLSATIDDRB1_0405, DRB1_0410 2
VIR020829339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]207YWLSATIDPDRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703 6
VIR020851339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]229FQPVRRFGWDRB1_0305, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_1101, DRB1_1307, DRB1_1321 7
VIR020854339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]232VRRFGWRIMDRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0410, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 17
VIR020859339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]237WRIMPQNLSDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506, DRB5_0101, DRB5_0105 49
VIR020873339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]251WKVYRNKTLDRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 7
VIR020875339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]253VYRNKTLGPDRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1327, DRB1_1328 15
VIR020876339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]254YRNKTLGPIDRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1128, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1323 16
VIR020881339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]259LGPISSVLTDRB1_0101, DRB1_0102 2
VIR020884339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]262ISSVLTYGSDRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423 5
VIR020887339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]265VLTYGSLVTDRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 6
VIR020888339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]266LTYGSLVTSDRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_1107 5
VIR020890339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]268YGSLVTSFKDRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0813, DRB1_1307, DRB5_0101, DRB5_0105 11
VIR020893339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]271LVTSFKQSADRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323 13
VIR020907339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]285LVRFGVAPSDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 47
VIR020908339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]286VRFGVAPSYDRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_1107 6
VIR020910339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]288FGVAPSYPADRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0402, DRB1_0408 4
VIR020920339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]298FAADVLANRDRB1_0309 1
VIR020925339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]303LANRLPRVSDRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328 17
VIR020934339631808 YP 004723450.1 phospholipaseC[MycobacteriumafricanumGM041182]312WVIPNVLESDRB1_0101, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 48
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