VMR_ID | miRNA | Virus | miRNA_Seq | Length | GC | Seed analysis miRBase |
Seed analysis VIRmiRNA |
Experimental Method | Target (if any) |
PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VMR_ID | miRNA | Virus | miRNA_Seq | Length | GC | Seed analysis miRBase |
Seed analysis VIRmiRNA |
Experimental Method | Target (if any) |
PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_1169 | sgiv-miR-1-3p | SGIV | aauugagcgugaagagccgucaggua | 26 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_1171 | sgiv-miR-1-5p | SGIV | uuaggcggcaacccgcucaguuuua | 25 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_1165 | sgiv-miR-10 | SGIV | gaaggaccuagacuuguauuugc | 23 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_1166 | sgiv-miR-11 | SGIV | uuuacgcggcgcgaacguauuucc | 24 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_1167 | sgiv-miR-12 | SGIV | cuacaccacggcguccgacuuua | 23 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_1168 | sgiv-miR-13 | SGIV | gaacggcaacgggagcacuaaauuuuug | 28 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_1170 | sgiv-miR-14 | SGIV | acauggacuuugacggcgacg | 21 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_1172 | sgiv-miR-2 | SGIV | aaggauacggcacgugguguuaugug | 26 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_1173 | sgiv-miR-3 | SGIV | aaacgugcuggccugcgcgcca | 22 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_1174 | sgiv-miR-4 | SGIV | gaagaggggcuagcgagaaaca | 22 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_1175 | sgiv-miR-5 | SGIV | aaacaaccggucguuguacugua | 23 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_1176 | sgiv-miR-6 | SGIV | aagucggacgccgugguguag | 21 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_1177 | sgiv-miR-7 | SGIV | gagcgcucaucggaggcaugggaa | 24 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_1178 | sgiv-miR-8 | SGIV | caagaacgccaccggaggauuuugaaa | 27 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_1179 | sgiv-miR-9 | SGIV | uuaacacgacgcgggacgauaaacgaaugu | 30 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_1180 | sgiv-miR-homohsv | SGIV | aguucacacggcagcauc | 18 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. |