VMR_ID | miRNA | Virus | miRNA_Seq | Length | GC | Seed analysis miRBase |
Seed analysis VIRmiRNA |
Experimental Method | Target (if any) |
PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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VMR_ID | miRNA | Virus | miRNA_Seq | Length | GC | Seed analysis miRBase |
Seed analysis VIRmiRNA |
Experimental Method | Target (if any) |
PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0319 | hsv2-miR-h10 | HSV2 | gggugcgggggugggcgg | 18 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0320 | hsv2-miR-h11 | HSV2 | uuaggacaaagugcgaacgcuu | 22 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0322 | hsv2-miR-h12 | HSV2 | uuaggacgaagugcgaacgcuu | 22 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0323 | hsv2-miR-h13 | HSV2 | uuagggcaaagugcgagcacug | 22 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0325 | hsv2-miR-h2 | HSV2 | ucugagccugggucaugcgcga | 22 |
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| Solexa(NGS), 454 | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0326 | hsv2-miR-h20 | HSV2 | uuugguuacggaccccuuucu | 21 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0327 | hsv2-miR-h21 | HSV2 | auaacgucaugcugucuacgg | 21 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0330 | hsv2-miR-h23* | HSV2 | acgagcuucgcgguacuacuc | 21 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0331 | hsv2-miR-h24 | HSV2 | cuccggcgccuuccccccgcccu | 23 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0332 | hsv2-miR-h25 | HSV2 | cugcgcggcggagaccgggac | 21 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0333 | hsv2-miR-h3 | HSV2 | uuugggagucugcgguugggag | 22 |
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| Solexa(NGS), 454 | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0338 | hsv2-miR-h6* | HSV2 | cccaucuucugcccuuccauccu | 23 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0339 | hsv2-miR-h7-3p | HSV2 | uuuggauuccgaccccucguc | 21 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0321 | hsv2-miR-h11* | HSV2 | aagcguucgcacuuuguccua | 21 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0324 | hsv2-miR-h19 | HSV2 | uucgcuaggcaagcacggacug | 22 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0328 | hsv2-miR-h22 | HSV2 | aggggucuggacgugggugggc | 22 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0329 | hsv2-miR-h23 | HSV2 | aggccguggagcuugccagc | 20 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0336 | hsv2-miR-h5 | HSV2 | gggggggcucgggccaccugacc | 23 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0337 | hsv2-miR-h6 | HSV2 | aauggaaggcgaggggaugc | 20 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0342 | hsv2-miR-h9-5p | HSV2 | cucggagguggagucgcggu | 20 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0334 | hsv2-miR-h4-3p | HSV2 | ccgugcuugccuagcgaacuc | 21 |
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| Solexa(NGS), 454 | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0335 | hsv2-miR-h4-5p | HSV2 | gaguucacucggcacgcaugc | 21 |
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| Solexa(NGS), 454 | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0340 | hsv2-miR-h7-5p | HSV2 | aaagggguccguaaccaaagg | 21 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
VMR_0341 | hsv2-miR-h9-3p | HSV2 | uucccaccucggucuccuccuc | 22 |
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| Solexa(NGS) | Expt. Pred. |